前往圓朱市的途中與意外的分離
小智、小霞與小剛在前往圓朱市的登山途中，偶遇了一隻背著背包、正獨自幫訓練家辦事的黑魯加。隨後，火箭隊現身企圖奪取皮卡丘，並派出雙彈瓦斯使出「煙幕」。在濃煙導致的混亂中，波克比不小心與眾人走散，獨自在森林中迷失了方向。
跨越恐懼的友情與守護
迷路的波克比在森林中再次遇見了黑魯加。黑魯加雖然外表兇猛，且被圖鑑描述為令人恐懼的寶可夢，但牠卻展現出了極其溫柔的一面。當波克比遇到野生的凱羅斯襲擊，或是因為肚子餓而哭鬧時，黑魯加不僅奮勇保護牠，還耐心地照顧牠。兩隻寶可夢一起跨越了湍急且有暴鯉龍棲息的河流，並在美麗花與安糖蝶飛舞的花田裡共度時光。當午後下起雷雨時，黑魯加更是用自己的身體為熟睡的波克比遮風擋雨，雙方建立了深厚的羈絆。
眾人的搜尋與最終會合
小智一行人利用貓頭夜鷹與大嘴蝠在空中搜尋，皮卡丘則在地面發現了波克比與大型寶可夢共同行動的足跡。眾人循著線索來到了阿公爺爺經營的牧場，原來這隻黑魯加是阿公爺爺派去鎮上購買咩利羊剪毛工具的夥伴。此時，火箭隊再次出現企圖搶走黑魯加與皮卡丘，但在黑魯加強大的「噴射火焰」與皮卡丘的「十萬伏特」聯手攻擊下，火箭隊再次被打飛。
依依不捨的告別
波克比平安回到小霞身邊後，在眾人即將啟程離開牧場時，波克比顯得非常依依不捨，甚至追著黑魯加向牠告別。黑魯加也溫柔地對著波克比長嘯回應。這段跨越種類與外貌偏見的友情，為小智一行人的旅程留下了一段溫馨且難忘的回憶。隨後，他們繼續朝著下一個目的地圓朱市前進。