抵達枯葉市與道館的威脅
小智、小霞與小剛經過長途跋涉，終於抵達了海邊城市「枯葉市」。由於連日趕路，眾人與寶可夢都顯得疲憊不堪且飢腸轆轆。在前往道館挑戰前，他們先來到寶可夢中心，卻驚見許多受傷嚴重的寶可夢被送往急救。喬伊小姐告知，這些寶可夢全是在道館挑戰中被館主馬志擊敗的犧牲者。儘管氣氛凝重，小智依然堅持挑戰，皮卡丘雖然心生恐懼，但在小智的鼓勵下也燃起了鬥志。
強大的對手：進化論的衝突
來到枯葉道館後，身材魁梧的馬志館主嘲笑小智是個「小北鼻」，並對未進化的皮卡丘嗤之以鼻。馬志堅信寶可夢應該在捕獲後立即進化的力量至上主義，並派出了進化型態「雷丘」應戰。戰鬥中，皮卡丘的電擊對雷丘毫無作用，反被雷丘威力驚人的電擊與強大的招式「百萬噸重拳」及「百萬噸重踢」打得體無完膚。首戰以皮卡丘慘敗並重傷住院告終。
進化的抉擇與皮卡丘的自尊
在寶可夢中心，喬伊小姐提供了一顆「雷之石」，指出只要讓皮卡丘進化成雷丘，就能獲得足以對抗馬志的力量。小智陷入了內心掙扎，他不希望只為了贏得比賽而強迫夥伴進化。然而，重傷蘇醒的皮卡丘展現了極強的自尊心，牠揮手拒絕了雷之石，堅持要以皮卡丘的身分戰勝雷丘。這份決心甚至感動了在一旁觀戰的火箭隊，讓他們決定暗中為皮卡丘加油，希望牠能為未進化寶可夢爭一口氣。
速度對決力量：反敗為勝的戰術
小剛觀察到雷丘雖然力量驚人，但因為過早進化，並未習得只有皮卡丘時期才能學會的速度技。第二次挑戰開始，小智採取了速度戰術，命令皮卡丘使用「高速移動」擾亂雷丘。當雷丘施展「十萬伏特」反擊時，皮卡丘利用尾巴作為避雷針刺入地面，成功排開了強大電流。在雷丘電力耗盡、動作變得遲鈍之際，皮卡丘發揮速度優勢連續重創對手，最終奇蹟般地擊倒了雷丘。
贏得信任與橘色徽章
馬志館主在敗戰後大方承認了小智與皮卡丘的實力，並親手頒發了代表道館勝利證明的「橘色徽章」。小智與皮卡丘的羈絆透過這次戰鬥變得更加堅不可摧，一行人帶著嶄新的自信與徽章，告別了馬志與枯葉市，繼續踏上成為寶可夢大師的修行旅程。