深谷中的不速之客
小智、小光與小剛在前往神和鎮的途中，受困於深谷中唯一的一條單行道。路中央坐著三隻神情嚴肅的可達鴨，牠們強勢地擋住去路。當小智試圖通過時，可達鴨竟施展強大的「念力」將小智一行人彈飛。為了開路，小智先後派出草苗龜與小火焰猴嘗試突破，小光也讓波加曼進行交涉與對戰，甚至連小剛的不良蛙、小福蛋以及小光的小山豬都輪流上陣，卻依然無法撼動這三隻守備森嚴的可達鴨。
隱藏在擋路背後的真相
就連隨後出現、企圖利誘可達鴨協助抓捕皮卡丘的火箭隊，也被可達鴨強大的力量擊飛。小智為了解開謎團，利用天蠍王與姆克鳥配合飛越崖壁進行偵察，驚訝地發現通道後方的水池邊還有其他可達鴨，其中一隻正守護著即將孵化的寶可夢蛋。小智這才明白，這三隻可達鴨並非無故鬧事，而是為了保護待產的同伴，才不讓任何人靠近。
同心協力擊退火箭隊
正當眾人理解真相時，火箭隊駕駛著大型機械再度襲擊，企圖強行抓走可達鴨。小智與夥伴們立刻挺身而出守護可達鴨，在雙方的共同努力下，再次讓火箭隊化作星辰。戰鬥結束後，新的可達鴨寶寶順利誕生，小剛也貼心地為這群一直沒能好好進食的可達鴨製作了美味的寶可夢食物，雙方終於建立起信任與友誼。
奪回家園與恢復平靜
小剛在觀察中發現，這群可達鴨棲息的水池異常狹小，這才發現原本屬於牠們的廣闊家園「可達鴨之池」被三隻蠻橫的臭臭泥霸佔。為了幫助可達鴨奪回領地，小智、小光與小剛聯手派出泳圈鼬、雙尾怪手與不良蛙，最後配合皮卡丘的「十萬伏特」一舉趕走了臭臭泥。隨著可達鴨家族重返寬敞的故鄉，深谷的通道也恢復了暢通，小智一行人告別了這群可愛的擋路者，繼續朝神和鎮邁進。