山頂上的漫長等待
小智、小霞與小剛在前往枯葉市的途中迷了路，在崎嶇的山路上，他們意外發現一隻坐在岩石上、看起來非常虛弱的小火龍。小智原本想收服牠，但這隻小火龍展現出極強的意志力，連續兩次彈開了精靈球。透過皮卡丘的溝通，眾人才明白這隻小火龍並非野生的，牠正遵守與訓練家的約定，在原地等待主人歸來。為了不打擾牠，小智一行人決定先前往附近的寶可夢中心。
冷酷的真相與冒雨救援
在寶可夢中心，他們遇到了一名叫做大介的傲慢訓練家，大介正向同伴炫耀自己拋棄了一隻「太弱」的小火龍，並撒謊說會回來接牠，好讓牠乖乖待在原地。聽聞真相的小剛憤怒地與大介發生衝突，卻被喬伊小姐及時阻止。此時戶外降下狂風暴雨，由於小火龍尾巴上的火焰若是熄滅便會死亡，小智與小剛不顧風雨危險，衝回山頂將被烈雀群攻擊且生命垂危的小火龍救回，並交由喬伊小姐進行緊急手術。
火箭隊的奇襲與小火龍的覺醒
經過一夜搶救，小火龍恢復了健康，但忠誠的牠隔天一早仍決定回到岩石處繼續等待大介。與此同時，火箭隊設計了全自動陷阱抓住了小智一行人，並穿上特殊絕緣橡膠裝企圖擄走皮卡丘。就在皮卡丘陷入危機時，小火龍及時現身，以強大的噴射火焰擊退了火箭隊。這一幕剛好被路過的大介看見，大介見小火龍變強了，竟厚著臉皮想要收回小火龍，甚至企圖動粗。
告別過去與新的夥伴
面對大介的背叛與無恥，小火龍終於看清了前主人的真面目，牠憤怒地拒絕了大介的精靈球，並用火焰將大介趕跑。小剛認為小智在暴雨中守護小火龍生命的精神，已經贏得了小火龍的信任，因此建議由小智來收服牠。最後，小火龍心甘情願地進入了小智的精靈球，正式成為小智的夥伴。隨著妙蛙種子與小火龍的加入，小智的旅程將繼續向枯葉市邁進。