命運的邂逅與失去花朵的花蓓蓓
正在前往娑羅市的小智一行人，在路途中短暫休息。柚麗嘉因為髮型一直弄不好而發脾氣，莎莉娜體貼地為她重新編髮，將髮型打理得像花朵綻放一般。沒想到，這組髮飾意外吸引了一隻失去花朵的「花蓓蓓」。小智等人透過寶可夢圖鑑了解到，花蓓蓓一生都會珍惜自己選中的花朵，但這隻花蓓蓓顯得極度衰弱，且一直依附在柚麗嘉那神似花朵的髮飾上。眾人正擔心之際，遇見了一位名叫格雷的老先生。
感人的過往與病床上的約定
格雷老先生解釋，這隻花蓓蓓是他妻子漢娜的搭檔。不久前，漢娜因病住進了海老根鎮的醫院，花蓓蓓因為擔心漢娜，在暴雨中試圖守候在病房窗外，卻不幸被風吹走並遺失了它視如生命的花朵。格雷提到，漢娜因為失去了花蓓蓓的陪伴，康復進度緩慢且意志消沉。為了讓花蓓蓓恢復活力並帶給漢娜勇氣，小智等人決定前往高原尋找稀有的「妖精之花」，因為花蓓蓓必須依附在這種特定的花朵上才能獲得能量。
高原上的阻礙與柚麗嘉的奮勇
眾人來到高原，卻發現妖精之花的季節已接近尾聲，難以尋獲。此時，火箭隊三人組偽裝成導遊出現，企圖誤導眾人並伺機奪取皮卡丘。在花蓓蓓體力將耗盡之時，小智等人終於在懸崖峭壁上發現了最後一朵綻放的妖精之花。考慮到花蓓蓓虛弱得無法獨自飛行，柚麗嘉奮不顧身地帶著它攀爬岩壁。儘管過程險象環生，柚麗嘉最終成功讓花蓓蓓與妖精之花重逢。花蓓蓓在獲得花朵後瞬間恢復了元氣。
花粉的神奇力量與圓滿的結局
火箭隊見狀現出身影並抓走了皮卡丘，小智等人派出的泡沫蛙、火狐狸與哈力栗陷入苦戰。此時，恢復體力的花蓓蓓散發出具有放鬆效果的花粉，讓火箭隊成員戰意全失，甚至自願放走了皮卡丘。危機解除後，一行人趕往醫院。看到花蓓蓓帶著美麗的妖精之花歸來，漢娜激動不已，重新燃起了對健康的渴望與元氣。在溫馨的道別聲中，柚麗嘉雖然不捨與花蓓蓓分開，但仍祝願它與漢娜幸福地生活，隨後小智一行人繼續踏上了前往卡洛斯聯盟的旅程。