香水店的爭執與體育館的禁令
小智一行人抵達了充滿花香的彩虹市。在當地的香水店中，小霞和小剛都對香水產生的療癒效果感到著迷，唯獨小智對香水嗤之以鼻，甚至出言不遜認為香水毫無意義。這番言論激怒了店長，隨後小智前往彩虹體育館挑戰時，竟因為曾侮辱香水而被體育館拒之門外。原來，該店的香水正是由體育館館主所研發，這讓小智陷入了無法獲得徽章的窘境。
變裝潛入與艾莉嘉的回憶
正當小智愁眉不展時，遇到了同樣想潛入體育館偷取「傳說香水」的火箭隊。在武藏和小次郎的提議下，小智被迫換上女裝化名為「小智子」，假裝成入學的新生，在火箭隊假扮的父母帶領下成功混入體育館。在館內，他見到小霞、小剛正和大家一起聽館主艾莉嘉說故事。艾莉嘉分享了她兒時在森林迷路、險遭臭泥攻擊時，被一隻臭臭花所救的溫馨往事，這也是她深愛草屬性寶可夢的原因。
彩虹體育館的正式對戰
儘管變裝精巧，皮卡丘仍靠氣味認出了小智，一記電擊讓小智的真面目當眾曝光。艾莉嘉接受了小智的挑戰，雙方展開三對三的對戰。艾莉嘉先後派出蔓藤怪與口呆花，小智雖然失去了妙蛙種子，但憑藉小火龍的火屬性優勢取得領先。然而，當艾莉嘉派出王牌臭臭花時，其散發出的強烈防衛臭氣讓小火龍與小智完全無法抵禦，對戰被迫中斷。
火場救援與意外的徽章
此時，火箭隊引爆了預藏的炸彈企圖趁亂偷走香水，導致體育館陷入熊熊大火。眾人忙著疏散寶可夢，艾莉嘉卻發現臭臭花被困在火海中。小智不顧安危衝入火場，儘管惡臭難耐，他仍堅持救出臭臭花。這份保護寶可夢的勇氣感動了艾莉嘉，在火勢撲滅後，艾莉嘉認為小智展現了對寶可夢最真誠的愛，決定授予他「彩虹徽章」。而火箭隊偷走的香水其實是未經稀釋的臭臭花精華液，最後在難聞的惡臭中自食其果。