火箭隊的秘密計畫與神祕的不良蛙
火箭隊三人組在美香鎮遭遇對戰挫敗後，喵喵在前往購買飲料的路上偶遇了一隻眼神犀利且神情古怪的不良蛙。這隻不良蛙不僅一路跟著喵喵回到基地，還在武藏與小次郎面前展示了強大的「毒擊」招式。武藏看中了不良蛙冷靜且強大的實力，決定利用牠實行「波瓦索道館」的假道館計畫，以館主身分騙取訓練家的寶可夢，並聲稱能為失敗的挑戰者提供強化訓練。
神祕的道館與美苗的挑戰
正前往黑金道館旅行的小智、小光與小剛，在森林中遇見了訓練家美苗及其夥伴巨鉗螳螂。美苗分享了關於新開張的波瓦索道館的傳聞，一行人決定前往一探究竟。在道館中，偽裝成「波瓦索公主」的武藏利用不良蛙輕鬆擊敗了挑戰者的穿山王。隨後美苗上場挑戰，雖然巨鉗螳螂展現了驚人的速度與力量，但在擔任裁判的小次郎刻意偏袒，以及不良蛙頑強的反擊下，巨鉗螳螂最終落敗，美苗也依約將巨鉗螳螂暫時寄存在道館進行訓練。
小智的對戰與火箭隊的真面目
接著輪到小智上場，他派出長尾怪手與不良蛙對戰。經過一番激戰，長尾怪手成功以「集中猛擊」擊敗不良蛙。然而火箭隊不甘心失敗，隨即捏造規則要求二連勝才能獲得徽章，並指名要與皮卡丘對戰。就在皮卡丘準備開戰時，火箭隊發動陷阱捕獲了皮卡丘並顯露真面目，企圖帶著巨鉗螳螂與其他搶來的寶可夢逃走。
奪回寶可夢與小剛的新夥伴
在小智的姆克兒協助下，皮卡丘成功脫困並反擊，以「十萬伏特」將火箭隊轟飛。戰後，美苗決定留在道館舊址等待其他受騙的訓練家來領回寶可夢。而那隻原本被火箭隊留下、充滿神祕感的不良蛙，在小剛的詢問下表達了願意跟隨的意願，成為了小剛的新夥伴。就在小剛再度向美苗熱情示愛時，不良蛙突然對小剛使出「毒擊」制止他的失態，這對充滿笑料的新組合也正式展開了牠們的旅程。