尋找失蹤的小勝與喵喵
承接前情，由於代歐奇希斯引發的地磁異常，小勝與喵喵被帶入了一個神祕的空間中。為了救回各自的同伴，小智一行人決定與火箭隊的武藏、小次郎暫時休戰，組成搜救隊伍。神奇寶貝保育家日向根據保育家基地的情報指出，目前正值太陽黑子擴大期，強烈的太陽風與山岳地帶的隕石產生了共鳴，這才是地磁異變與代歐奇希斯陷入混亂的真正原因。
代歐奇希斯的孤獨與心聲
在神祕的異空間內，小勝發現喵喵被代歐奇希斯控制，充當與人類溝通的翻譯媒介。透過喵喵的轉述，代歐奇希斯傳達了它獨自一人在寒冷寂靜的宇宙中航行的極度恐懼與孤單。它原本以為來到這顆星球能見到其他人，沒想到卻仍是隻身一人，因此對外界感到恐懼，只想躲在隕石這個「搖籃」裡。小勝溫柔地與它對話，並告訴它這個世界上還有許多神奇寶貝和人類，它絕不是孤單一人。
隕石暴走與捕獵行動
隨著太陽風持續增強，隕石內部的能量開始失控暴走，這股強大的能量讓代歐奇希斯痛苦萬分，導致它在各個形態間不斷切換並發動攻擊。為了救助代歐奇希斯，日向提議必須先將其捕獵，並引導它使出「自我再生」來修復受損的身體狀態。小智派出蜥蜴王、大王燕、沼躍魚等神奇寶貝全力配合，透過精準的牽制攻擊，終於迫使代歐奇希斯在疲憊中轉回普通形態，讓日向成功完成了捕獵。
友情的守護與新的旅程
在代歐奇希斯成功進行「自我再生」恢復神智後，暴走的隕石終於引發了大爆炸。在危急時刻，代歐奇希斯使出「神祕守護」保護了小智一行人、小勝、喵喵以及山谷中的野生神奇寶貝。危機化解後，代歐奇希斯感受到了小勝的溫情，並透過喵喵傳達它想要去看看這個星球、與更多神奇寶貝相遇的願望。最後，代歐奇希斯在天空中留下美麗的極光後飛向遠方，小勝也與它約定未來一定會再次見面。