意外的邂逅與強大的勁敵
在前往濕原市的旅途中，小智、小光與小剛正在森林裡享受午餐。此時，皮卡丘與波加曼在附近玩耍時，遇到了一位名叫阿修的訓練家與他的皮丘。阿修誤以為皮卡丘是野生寶可夢而發動攻擊。小智趕到後，阿修展現出極度傲慢的態度，他自稱是追求「進化的最強組合」的訓練家，希望能收集皮丘、皮卡丘與雷丘的最強型態。阿修看中了小智這隻培育優異的皮卡丘，提出要用自己的寶可夢進行交換，但被小智斷然拒絕。雙方隨即展開一場激烈的寶可夢對戰。
慘敗的挫折與進化的抉擇
對戰中，阿修派出體型巨大且充滿力量的雷丘。儘管皮卡丘奮力反擊，但雷丘展現出壓倒性的實力，不僅能使出威力驚人的「伏特攻擊」，還能使用皮卡丘目前無法學會的強力招式「破壞光線」。在實力懸殊的情況下，皮卡丘被雷丘重創，陷入昏迷並被緊急送往寶可夢中心。此時，真司出現在一旁冷嘲熱諷，直言這場對戰毫無參考價值，並建議小智讓皮卡丘進化以拉近實力差距。看著病床上痛苦的皮卡丘，小智拿出了多年前在枯葉市獲得的「雷之石」，內心陷入了是否要讓皮卡丘進化以獲得力量的掙扎。
火箭隊的堅持與特訓開始
就在小智考慮進化的可能性時，一直在旁觀戰的火箭隊三人組也有感而發。喵喵感同身受地表示，即使不進化也能變強，並偷偷潛入寶可夢中心「偷走」了雷之石（其實是為了阻止皮卡丘進化）。皮卡丘醒來後，展現出堅定的眼神，向小智表示牠希望以皮卡丘的身分再次挑戰雷丘。理解了搭檔心意的小智深受感動，決定利用皮卡丘靈活與速度的優勢，結合小光在華麗大賽中使用的旋轉技巧，展開針對雷丘強大火力的特訓，準備迎接復仇之戰。
速度與力量的交鋒：最終勝負
翌日，小智再次向阿修挑戰。面對雷丘勢不可擋的「鐵尾」與「伏特攻擊」，皮卡丘運用特訓成果，以旋轉跳躍完美迴避了攻擊，並消磨對方的體力。當雷丘再次使出必殺的「破壞光線」時，小智指揮皮卡丘利用「十萬伏特」與「伏特攻擊」產生的衝擊力抵銷光線，並抓準雷丘因招式反作用力無法動彈的空隙，使出最強的「伏特攻擊」接「鐵尾」組合技。最終，皮卡丘成功擊敗了雷丘。阿修輸得心服口服，承認了小智與皮卡丘的羈絆與實力。小智與皮卡丘在這次事件中再次確認了彼此不需要依靠進化的力量，只要心靈相通就能克服任何困難，繼續邁向神奧聯盟的挑戰。