晉級十六強與對戰組合發表
在合眾聯盟檜垣大會的第二輪比賽中，小智的滑滑小子發揮出色，成功擊敗了對手的火紅不倒翁，讓小智順利晉級前十六強。賽後，大會公布了第三輪比賽的對戰名單，小智驚訝地發現自己的對手竟是好友肯尼洋。與此同時，巴吉爾、虎徹與白露等勁敵也紛紛晉級。由於第三輪對戰將採用三對三的對戰模式，小智與肯尼洋都各自展開了心理戰，思考著該如何挑選出戰的夥伴。
意外的插曲：牙牙在慶祝活動中失蹤
就在眾人準備迎接明日大賽的休息期間，白露興奮地拉著大家要去買檜垣大會限定的「飛雲冰淇淋」。混亂中，艾莉絲的牙牙被一陣熱鬧的應援團聲音所吸引，牠戴上了路人掉落的帽子，陰錯陽差地跟著慶祝的人潮越走越遠。當艾莉絲發現牙牙不見時，眾人焦急萬分，幸好巴吉爾利用身為救援隊的經驗，透過監控影像鎖定了牙牙最後出沒的地點。小智與艾莉絲也派出皮卡丘、水水獺、滑滑小子與導電飛鼠展開大規模搜索。
巷弄裡的衝突：灰塵山與破破袋的憤怒
牙牙在小巷中被一群野生的破破袋與一隻體型巨大的灰塵山圍住。當小智一行人趕到時，愛吃的水水獺竟不小心吃光了這群野生寶可夢囤積的糧食，導致灰塵山怒火中燒，雙方爆發激烈的追逐。面對憤怒的灰塵山，巴吉爾冷靜地指挥太陽伊布與月亮伊布協助防禦，並使用「安撫之鈴」發出溫和的鈴聲讓灰塵山平靜下來。最後，小智與天桐準備了豐盛的寶可夢食物，不僅化解了衝突，也讓這群巷弄裡的寶可夢飽餐一頓。
三回戰開幕：小智對決肯尼洋
經歷了一場虛驚後，眾人聚在一起觀賞壯麗的檜垣大會煙火，慶祝彼此的友誼與晉級。小智也與阿拉拉吉博士取得聯繫，完成了寶可夢的傳送調整。翌日清晨，第三輪的第一場對戰正式在主會場展開，由小智對戰肯尼洋。肯尼洋一開場就派出了動作敏捷的酷豹，展現出志在必得的氣勢；而小智也充滿鬥志地派出了他的第一隻寶可夢，兩人的強強對決正式揭開序幕。