熱血的特別課：寶可棒球開打
故事開端，小智與皮卡丘在庫庫伊博士家中興奮地觀看「寶可棒球」職業聯賽。當看到偶像球星歐魯歐魯打出再見場外全壘打，帶領「鯉魚王隊」奪冠後，小智也燃起了想打棒球的渴望。隨後在庫庫伊博士的安排下，寶可夢學校迎來了特別課，而擔任特別教練的正是聯賽英雄、同時也是學校畢業生的歐魯歐魯選手與他的搭檔卡比獸。
校內的激烈對抗賽
在歐魯歐魯的指導下，學生們分成小智隊與卡奇隊進行三對三的「三角棒球賽」。卡奇展現了驚人的運動天賦，投球時甚至融入了Z招式「超強極限爆焰彈」的氣勢；而小智則與皮卡丘默契配合。比賽中，莉莉艾雖然害怕球，但在白滾滾的鼓勵下勇敢地面對。最後，水蓮使出驚人的「一本釣打法」打出場外全壘打，幫助小智隊以4比3險勝，充分展現了寶可夢與訓練家共同運動的樂趣。
火箭隊的挑戰與歐魯歐魯的豪賭
正當大家沈浸在比賽樂趣時，身為歐魯歐魯狂熱粉絲的武藏帶著火箭隊成員現身。火箭隊原本意圖奪取寶可夢，但武藏更渴望得到歐魯歐魯的簽名，於是雙方約定以一場寶可棒球賽決勝負。歐魯歐魯與卡比獸加入學校隊，與火箭隊展開激戰。比賽中，火箭隊的喵喵展現了秘密特訓的成果，投出令小智等人陷入苦戰的神奇球路；而謎擬Ｑ則因對皮卡丘的強烈執著，竟朝著打擊區的皮卡丘投出觸身球。
卡比獸爆發！認真起來大攻擊
比賽來到最後關頭，兩隊戰況膠著。九局下半，輪到平時總是在睡覺的卡比獸上場打擊。喵喵使出了必殺魔球，但卡比獸在歐魯歐魯的指揮下展現了驚人的爆發力，將球擊出。眼看球快被接住，歐魯歐魯啟動了專屬Z招式「認真起來大攻擊」，卡比獸瞬間爆發出驚人的跑壘速度，化作一道重力衝擊直奔本壘，最終為學校隊奪下勝利。賽後，歐魯歐魯感佩火箭隊的精彩表現，即便他們輸了仍大方贈予簽名。最後，火箭隊照慣例在穿著熊的「護送」下離開，而小智與朋友們也在這場特別課中深刻體會到了運動競技的熱血與友情。