抵達濕原市與濕原大濕地
小智、小光與小剛一行人為了挑戰第四個道館，來到了濕原市。他們在濕原道館門口巧遇了道館館主吉憲。性格豪邁的吉憲表示現在有急事要辦，便邀請小智等人一同前往。眾人跟隨吉憲搭乘列車，來到了廣闊的「濕原大濕地」。在這裡，他們發現草叢中到處都是野生不良蛙的蹤跡。
不良蛙祭典與冠軍爭奪戰
吉憲向大家解釋，不良蛙在濕原市被視為守護神，幾乎家家戶戶都會飼養。而今晚正是每年一度的「不良蛙祭典」，會從中選出當年的冠軍，並授予鑲有鑽石與珍珠的華麗王冠。隨後，眾人遇到了喬伊小姐，她正被去年冠軍不良蛙「蛙彥」的訓練家拓也糾纏。拓也希望他的「蛙彥」能娶喬伊小姐的不良蛙「蛙美」為妻。小剛為了守護喬伊小姐，決定讓自己的不良蛙參加祭典並贏得冠軍，以挫挫拓也的銳氣。
選拔過程與火箭隊的計謀
祭典評審由吉憲、喬伊小姐以及車站站長擔任。第一輪是外觀審查，小剛的不良蛙憑藉著銳利的眼神獲得好評；而火箭隊的喵喵為了奪取王冠，也偽裝成不良蛙參賽。第二輪是劈瓦大賽，參賽的不良蛙必須挑戰擊碎十塊疊在一起的磚塊。小剛的不良蛙展現出強大的實力，完美擊碎所有磚塊，成功闖進決賽，對決拓也的「蛙彥」。
混亂的決賽與驚人的逆轉
正當小剛的不良蛙與拓也的「蛙彥」在決賽中打得難分難解、互不相讓時，火箭隊駕駛著巨大的不良蛙機器人闖入會場，不僅搶走了冠軍王冠，還用捕捉網抓走了會場所有的不良蛙。危急時刻，吉憲卻發現自己竟然將神奇寶貝球忘在道館裡。混亂中，喬伊小姐的「蛙美」展現出隱藏的強大實力，以一招威力驚人的「真空波」擊損了機器人，隨後小智的皮卡丘使用十萬伏特將火箭隊徹底擊飛。
祭典落幕與未來的道館戰
王冠順利找回後，吉憲認為「蛙美」守護了祭典功不可沒，在拓也與小剛的贊同下，正式宣布喬伊小姐的「蛙美」成為今年的冠軍。吉憲在見識過小智皮卡丘的實力後，欣然接受了小智的道館挑戰，約定隔日進行正式對決。最終，眾人在熱鬧的「神奇寶貝音頭」舞蹈中，享受著祭典餘韻，而小智也為即將到來的第四場道館戰燃起了熱鬥之魂。