抵達吉野市與沼王的偶遇
正朝著城都聯盟目標前進的小智、小霞與小剛一行人，來到了環境優美且水質清澈的吉野市。在河邊休息時，小智正忙著保養他的寶可夢球，其中也包含了大木博士交辦的神秘GS球。此時，一隻沼王突然出現，並從小智手中搶走了GS球。小智本想派出傑尼龜奪回並收服這隻沼王，卻被及時趕到的君莎小姐制止。君莎小姐告知，吉野市設有沼王保護條例，由於沼王只棲息在乾淨的河流，是水質的指標，因此當地嚴禁對沼王進行對戰或收服。
圓形物品的傳統與GS球再次遺失
大木博士隨後也在通訊中提醒小智要注意當地的習俗。君莎小姐解釋，每年的這個季節，沼王們會到鎮上尋找喜歡的「圓形物品」，並將其帶往「青色滿月瀑布」供奉。傳說這些物品會在隔天順著河流漂回鎮上，並為物主帶來幸運與潔淨的水。儘管小智萬分小心，但那隻沼王對GS球情有獨鍾，甚至追到了寶可夢中心。在混亂中，小智的菊草葉因想獨佔小智的關愛，不慎造成失誤，使得GS球最終還是被沼王帶走了。
火箭隊的野心與瀑布的奇幻儀式
另一方面，火箭隊的武藏、小次郎與喵喵也因為私人物品被沼王拿走而懷恨在心，計畫捕捉所有的沼王來大賺一筆。小智一行人追蹤沼王來到上游的青色滿月瀑布，目睹了成群的沼王正準備進行儀式。此時火箭隊駕駛機械裝置現身並抓走了大量沼王與皮卡丘。為了拯救沼王，小智與妙蛙種子發動攻擊，而沼王們也集體反擊，最終成功擊飛火箭隊。隨後，在藍色的滿月下，沼王們開始對著月亮拋射圓形物品，而GS球飛得比任何物品都高，展現出奇幻的景象。
最後的幸運與旅程的延續
儀式結束後，所有圓形物品順著河流漂回吉野市。隔天清晨，鎮民們紛紛在河邊領回自己的物品。君莎小姐親手將GS球交還給趕回鎮上的小智，並驚喜地表示GS球是最後一個流回來的物品。根據吉野市的傳說，最後一個回來的物品象徵著「今年最大的幸運」。小智得知後興奮不已，認為這是他在城都聯盟奪冠的好兆頭。帶著這份幸運與奪還的GS球，小智一行人繼續邁向新的冒險旅程。