常磐森林的獨角蟲與神祕武士
小智與小霞持續在常磐森林中旅行。小智在森林中發現了獨角蟲，正打算派出比比鳥進行捕捉時，一名裝扮成武士的少年突然出現並揮刀制止。這位武士少年正在森林中進行修行，他一直在尋找來自真新鎮的訓練家進行對決。由於他的干擾，原本快被抓到的獨角蟲趁機逃走，這讓小智感到非常不滿，於是接受了武士少年的挑戰。
凱羅斯的威力與鐵甲蛹的僵持
對戰開始後，武士少年先派出了強大的凱羅斯。小智的比比鳥因為先前追捕獨角蟲已疲憊不堪，在對戰中落於下風，隨後小智更換鐵甲蛹上場。鐵甲蛹使用「變硬」招式，成功抵擋了凱羅斯的強力角擊，甚至讓凱羅斯的角受損。武士少年見狀收回凱羅斯，同樣派出了自己的鐵甲蛹對陣。於是，雙方展開了一場漫長的「變硬對決」，兩隻鐵甲蛹不斷強化防禦，陷入無止盡的僵持，讓一旁的小霞感到極度無奈與受不了。
大針蜂群的逆襲與落難
就在雙方僵持不下時，先前逃走的獨角蟲引來了成群的大針蜂報復。混亂中，小智的鐵甲蛹被其中一隻大針蜂叼走，並掉落在鐵殼蛹的巢穴附近。小智一行人為了躲避蜂群攻擊，躲進了武士少年的避難小屋。武士少年提到，在他之前遇到的三位真新鎮訓練家（包含小茂）都實力強勁，這讓他對小智的草率表現感到失望，並指責小智身為訓練家的不足。小智內心感到十分愧疚，守在窗邊等待救援鐵甲蛹的時機。
小智的覺悟與鐵甲蛹進化
隔天清晨，小智潛入巢穴試圖救回鐵甲蛹，卻倒霉地遇到火箭隊出現，他們大聲唸出登場台詞驚醒了整群大針蜂。在混亂的逃跑過程中，小智對著鐵甲蛹真誠道歉，發誓再也不會為了自己的失誤而丟下夥伴。當大針蜂發動攻擊時，小智捨身擋在鐵甲蛹面前，這份真摯的感情觸動了鐵甲蛹。鐵甲蛹在關鍵時刻進化成巴大蝶，並展現出驚人的實力，使用「睡眠粉」讓整群大針蜂和火箭隊都陷入沉睡，成功化解危機。
邁向尼比市的新旅程
見識到小智與巴大蝶之間的強大羈絆後，武士少年對小智刮目相看，認可了他是一名真正的訓練家。兩人冰釋前嫌，在森林出口互相勉勵，並相約未來再次對決。隨後，小智與小霞順利穿過常磐森林，帶著進化後的巴大蝶，滿懷信心地朝著下一個目的地——尼比市前進。