金黃市的拉麵與道場之爭
在小遙成功於金黃市的大會中贏得緞帶勳章後，小智一行人正準備前往下一個目的地。小遙心心念念想品嚐金黃市極受歡迎的「戰鬥拉麵」，而小智與小勝則受一張傳單吸引，希望能前往當地的「格鬥道場」觀摩實戰。當眾人到達拉麵店時，卻發現店主京太郎被一名叫繼代的女子強行帶走。原來，京太郎是格鬥道場主人濱栗的兒子，濱栗執意要兒子繼承道場，但京太郎卻只對製作拉麵感興趣。小智等人跟隨至道場後，小智與皮卡丘竟被濱栗誤認為是新入學的弟子，莫名其妙地開始了清掃道場的修行。
代理人之戰：沙瓦郎對抗艾比郎
為了決定道場的繼承權，濱栗提議以寶可夢對戰來定勝負：若京太郎輸了就得繼承道場，贏了則能自由經營拉麵店。濱栗派出了沙瓦郎（飛腿郎），而京太郎則派出艾比郎（快拳郎）。然而對戰才剛開始，濱栗就因為閃到腰（急性腰痛）而動彈不得。為了讓京太郎能回去做拉麵，小遙自告奮勇擔任京太郎的代理人；而小智則因為想體驗格鬥寶可夢的對戰，接替濱栗擔任沙瓦郎的指揮官。雙方隨即展開了嚴格的特訓，小遙展現出對拉麵的強烈執著，而小智則展現出與沙瓦郎極佳的默契。
夢想與傳承的真諦
在正式的代理大戰中，沙瓦郎的踢技與艾比郎的拳擊互不相讓，戰鬥進入白熱化。正當雙方準備同時使出王牌招式「真氣拳」一決雌雄時，火箭隊突然駕駛著由拉麵攤改裝的巨大機器人闖入並擄走了寶可夢。此時，道場唯一的弟子繼代派出了戰舞郎，以華麗的「高速旋轉」與「百萬噸踢腿」救回寶可夢，最後在皮卡丘的十萬伏特助攻下擊飛了火箭隊。
溫馨的和解與新的旅程
戰鬥中斷後，京太郎向父親坦白，自己之所以執著於拉麵，是希望能重現兒時父親親手為他做的那碗拉麵的味道。深受感動的濱栗終於理解了兒子的心意，同意京太郎追尋自己的廚藝夢，並由繼代正式接管並繼承格鬥道場。令人意外的是，濱栗隨後透露自己的夢想竟是推著拉麵攤環遊世界，並親手做出當年那碗令京太郎難忘的拉麵給大家品嚐。在解決了道場風波後，一行人品嚐著美味的拉麵，心滿意足地告別金黃市，朝著下一個戰鬥設施「對戰競技場」出發。