火箭隊的糧食危機
故事開始於火箭隊的祕密基地，武藏、小次郎與喵喵正為糧食短缺而苦惱。自從貪吃的野生莫魯貝可住進基地後，它吃光了火箭隊所有的點心與打工賺來的辛苦錢。為了擺脫這個沉重的負擔，火箭隊決定將莫魯貝可放生野外，並指派小次郎執行這項任務。
失敗的放生計畫
小次郎將莫魯貝可帶到偏遠的山區，本想趁其不備悄悄離開，但看到莫魯貝可天真可愛的模樣又不忍心，甚至還買了大量食物給它吃，希望它能在那裡好好生活。然而，當小次郎回到基地時，卻驚訝地發現莫魯貝可早已憑藉著對食物的執著先一步回到基地，並把武藏和喵喵私藏的點心全部吃光，讓放生計畫徹底失敗。
莫魯貝可收服作戰
火箭隊隨後發現正在收服寶可夢的小智與小豪，小豪成功收服了拉達，這讓武藏靈機一動，決定設計陷阱引誘小豪收服這隻大胃王莫魯貝可，好把麻煩轉嫁給小鬼頭。他們嘗試多種方法引起小豪的注意，甚至讓武藏偽裝成占卜的老婆婆，指引小豪前往莫魯貝可所在的地點。然而，小豪卻屢次被其他出現的寶可夢（如比比鳥）吸引注意力，導致計畫一再碰壁。
櫻木研究所的騷動
在一次物流失誤中，莫魯貝可意外混進了送往櫻木研究所的寶可夢食物箱裡。進入櫻木公園後，飢腸轆轆的莫魯貝可切換成「空腹花紋」模式，性格變得極其凶暴，瘋狂搶奪其他寶可夢的食物。小智的路卡利歐與小豪的閃焰王牌試圖阻止它，卻反被莫魯貝可強大的實力壓制。小豪見狀試圖投球收服，但球被莫魯貝可輕易撥開，最終莫魯貝可在吃飽後消失在研究所。
正式成為新夥伴
火箭隊為了完成奪取寶可夢的使命，在購物中心展開大規模捕獲行動，小智和小豪及時趕到。火箭隊使用扭蛋機召喚出天然雀與蛇紋熊應戰，戰鬥進行到一半時，莫魯貝可再次因飢餓出現。它使出的「跺腳」招式展現了壓倒性的威力，不僅讓皮卡丘與閃焰王牌陷入苦戰，最後甚至因為憤怒將火箭隊全體擊飛。在混亂結束後，小豪順利收服了之前逃掉的比比鳥。而在森林中，小次郎看著找尋過來的莫魯貝可，終於下定決心拿出精靈球將其收服，莫魯貝可正式成為了火箭隊的新夥伴。