飢腸轆轆與乾涸的村莊
小智、小霞與小剛在前往寶可夢大師的修行途中，正處於極度飢餓的狀態。他們在路上遇到一位吹奏「寶可夢之笛」的老爺爺，對方索要食物作為聽曲的報酬，但三人身上空無一物，老爺爺隨後便離去。當他們抵達附近的村莊時，發現這裡的麵包店、蔬菜店甚至是餐廳竟然都沒有任何食物可賣。村長向他們解釋，由於上游的河流在兩週前突然乾涸，導致農作物無法生長，村莊陷入了嚴重的糧食危機。為了報答村長的招待，小智一行人決定前往上游調查斷流的原因。
水源處的巨大障礙物
眾人排除萬難，在妙蛙種子與寶石海星的幫助下穿過茂密的荊棘林，驚訝地發現一隻巨大的卡比獸正躺在水源出口呼呼大睡，巨大的身軀徹底擋住了整條河流。根據寶可夢圖鑑的說明，卡比獸是目前發現最重的寶可夢，重量超過460公斤，且只有在進食時才會醒來。小智他們嘗試了合力推擠、投擲精靈球，甚至是對著它大聲喊叫，都無法動搖這隻沉睡的巨獸分毫。
火箭隊的干擾與奇葩策略
隨後趕到的火箭隊也打起了卡比獸的主意，希望能將它捕捉後獻給老大。他們先是嘗試用熱氣球搭配鋼索吊起卡比獸，卻因重量太重導致鋼索斷裂失敗；接著又嘗試用一堆鬧鐘叫醒它也無濟於事。最離譜的是，武藏和小次郎受到童話故事《睡美人》的啟發，硬是讓喵喵裝扮成「王子」去親吻卡比獸，結果卡比獸不但沒醒，反而像是做了惡夢般顯得極度痛苦。就在大家束手無策時，小智發現卡比獸身旁有一塊牌子，上面寫著「若要叫醒請使用寶可夢之笛」。
寶可夢之笛的旋律與村莊的重生
小智想起之前遇到的那位老爺爺擁有的笛子，於是趕緊跑回去尋求幫助。雖然火箭隊試圖爭奪老爺爺的所有權，但小智指揮比比鳥使用「吹飛」將他們擊退，成功將老爺爺請到了水源處。原來這隻卡比獸是老爺爺養的，他每個月固定會來喚醒它一次。隨著悠揚的笛聲響起，卡比獸終於醒了過來。雖然卡比獸移開了位置，但水流仍被繁茂的荊棘堵住，沒想到這隻卡比獸竟將阻擋水流的荊棘當作大餐，一口氣全部吞下肚子。水源終於恢復流動，村莊也隨之恢復生機。在享受了一頓豐盛的報答大餐後，小智一行人再次踏上旅程。