幼基拉斯的誕生與冰冷的心
小智、小霞與小剛在前往若葉鎮的途中，一直悉心守護著從空木博士那裡委託照顧的寶可夢蛋。在大家的期盼下，這枚神祕的蛋終於孵化，誕生了「岩石皮膚寶可夢」幼基拉斯。然而，這隻幼基拉斯出生時體溫極低，且對外界環境完全沒有任何反應，彷彿心靈被封閉了一般。眾人急忙趕往最近的寶可夢中心，喬伊小姐發現幼基拉斯雖然身體無恙，但精神狀態極度不穩定。此時，火箭隊切斷電源並偽裝成醫療人員企圖搶奪幼基拉斯，所幸小剛憑藉對喬伊小姐的「氣息感應」識破偽裝，配合皮卡丘擊退了火箭隊。
揭開心理創傷與小智的溫情感化
隨後，空木博士、大木博士以及小智的媽媽花子也趕到中心會合。經過診斷，雖然幼基拉斯恢復了意識，但依然不吃不喝。小智提到，他在抱著蛋的時候曾感應到幼基拉斯的夢境，畫面中充滿了大型機器的轟鳴聲與粗暴的運送過程，揭示了幼基拉斯在蛋的時期曾遭受偷獵者搶奪而留下嚴重的創傷。為了讓幼基拉斯重新信任世界，小智帶著它來到草原，耐心地向它介紹陽光、微風與草地的溫暖，告訴它外面的世界並不可怕，而是一個充滿樂趣的地方。
覺醒力量爆發與敞開心扉
火箭隊再度駕駛具備防電功能的「猜拳機器人」來襲，不僅抓走了皮卡丘，還粗暴地驅趕現場的毽子棉。看到守護自己的小智與善良的寶可夢們受到傷害，幼基拉斯終於克服內心的恐懼，先後發出驚人的「刺耳聲」與威力強大的「覺醒力量」，一舉將火箭隊打飛。雖然幼基拉斯在面對小霞與小剛等陌生人時依然會害羞地僵住（變硬），但它已經明顯對小智產生了信任，並開始對周遭的美麗花等寶可夢展示笑容。
前往白銀大會與新的任務
一行人來到若葉鎮，小智成功完成了城都聯盟白銀大會的參賽登記。空木博士考量到幼基拉斯的性格與成長，拜託小智在參加大會前，將這隻幼基拉斯送回它的故鄉——白銀山的寶可夢保護中心。在大木博士與花子的鼓勵下，小智接下了這項重任。帶著剛出生的夥伴幼基拉斯，小智一行人再次啟程，目標直指白銀山與即將開幕的白銀大會。