荒野中的神秘機器人與布里卡隆
小智一行人在前往映雪道館的途中，於一片荒蕪的大地上遇到了一個正在辛勤耕耘的古舊機器人「洛本」。正當眾人感到好奇時，哈力栗的最終進化形「布里卡隆」突然出現並發動攻擊，似乎在守護著洛本，不讓外人干擾它的工作。為了避免衝突，眾人決定暫時撤離，卻隨後發現了一座研究機構。
市谷老師的遺願與美之森的過去
小智他們遇到了居住在研究所的少年希羅，並得知那張照片中的老者正是他的祖父市谷老師。透過老師生前留下的錄影帶，眾人了解此地曾是被稱為「美之森」的綠色樂園。然而，森林不明原因枯萎，市谷老師在病重之際開發了洛本，希望它能與布里卡隆攜手恢復森林。希羅雖然感激祖父的初衷，但看著洛本與布里卡隆多年來在乾裂土地上徒勞工作而日漸損壞，曾一度想讓它們停止，但希特隆以科學家的精神鼓勵大家，只要不放棄，科學就能創造未來。
尋找地下水脈與岩盤的挑戰
希特隆發揮專長，不僅修復了洛本的充電機能，還拿出了發明「土壤分析模擬器」，分析結果顯示目前的土質缺乏水分。為了讓森林復甦，眾人決定尋找水脈。在倫琴貓的透視能力、嗡蝠的超音波，以及哈力栗與布里卡隆利用藤鞭感應地下的合力搜查下，終於在地下深處發現了水源。然而，水源上方被一層巨大的岩盤堵住，即使眾多寶可夢合力發動技能攻擊，甚至嘗試用體力拉動，也無法撼動岩盤分毫。
火箭隊的亂入與洛本的奇蹟
正當陷入僵局時，火箭隊突然現身企圖搶走皮卡丘與布里卡隆。混戰中，洛本為了保護地上的種子，遭到火箭隊的攻擊而嚴重損毀並停機。目睹好友受傷的布里卡隆憤怒爆發，展現強大力量配合小智等人的寶可夢將火箭隊擊飛。事後，希特隆通宵達旦進行修理，堅信科學不應在放棄的那一刻停止，最終成功讓洛本重新啟動。令人驚喜的是，洛本內建了市谷老師留下的「岩石除去迴路」，它發揮出超乎預期的力量粉碎了岩盤，清澈的水源終於噴湧而出，枯萎的大地重新獲得了生機。
繼承科學意志與新的出發
隨著地下水的復甦，土壤分析顯示森林重生的目標已不再是夢想。看著水源流向遠方，希羅深受感動，並向希特隆承諾自己未來也要成為一名發明家，親自守護並維修洛本與布里卡隆。小智一行人告別了希羅與這群守護森林的夥伴，帶著滿滿的熱血與希望，繼續朝著映雪ジム的目標前進。