職業體驗日的意外開端
小智在參與寶可夢學校的「職業體驗日」當天差點遲到。在前往學校的途中，他遇見了骷髏隊的三人組。雙方展開對戰，但在戰鬥中，隊員吉普的灰塵山試圖使出「毒液衝擊」時卻發生故障，不僅噴不出毒液，還散發出難聞的惡臭。小智以皮卡丘的十萬伏特擊退對方後，好心建議他們帶灰塵山去寶可夢中心檢查。隨後，小智趕到學校，向朋友們介紹新夥伴毒貝比，並準備開始一天的實習。
代班喬伊小姐：寶可夢中心的忙碌日常
當眾人抵達寶可夢中心準備開始體驗時，發現喬伊小姐因感冒病倒了。為了報答平日的照顧，小智與朋友們決定代班營運寶可夢中心。在洛托姆圖鑑的協助下，眾人換上制服——其中小智因為找不到合適的男用制服，竟被瑪奧等人「改造」成了可愛的喬伊造型。大家各司其職：莉莉艾與瑪奧負責櫃檯接待與照護，水蓮與馬瑪內負責整理客房，而小智與卡奇則負責外送藥品以及幫大型寶可夢進行護理。外送過程中，小智意外遇到了喬裝成甜甜圈店員的小次郎，並為他的好壞星送達了保濕霜。
拯救灰塵山！專業的毒堵塞處理
就在大家忙碌之際，骷髏隊的吉普帶著痛苦不堪的灰塵山來到中心。莉莉艾推斷灰塵山患了罕見的「毒堵塞」，是因為長期缺乏護理導致毒液凝固。正當孩子們束手無策時，來自阿卡拉島的喬伊小姐趕來支援（她是這間中心喬伊小姐的姊姊）。在阿卡拉喬伊小姐的指導下，大家齊心協力進行特別護理。小智與卡奇負責用巨大的耳棒疏通堵塞物，馬瑪內與水蓮負責接應毒液，瑪奧與莉莉艾則幫忙按摩手臂以促進循環。
體驗圓滿結束與夥伴的牽絆
經過一番努力，小智終於拔出了堵住灰塵山指尖的凝固毒塊，雖然伴隨著毒液噴發的惡臭，但灰塵山終於恢復了健康並感到舒適。吉普雖然表面倔強，但最後還是買了一支巨大的耳棒作為「伴手禮」，暗示他未來會好好照顧夥伴。原本感冒的喬伊小姐在花療環環的悉心照料下也順利康復。這次的職業體驗讓小智與夥伴們深刻體會到醫護工作的辛苦與守護寶可夢健康的快樂，洛托姆圖鑑也完整記錄下了這難忘的一天。