午後的意外相遇與火箭隊的新機械
在前往城都聯盟的旅途中，小智、小霞與小剛正在草地上午睡休養生息。調皮的波克比在大家熟睡時獨自走開，遇見了一隻年幼的野生尾立，兩隻寶可夢很快就玩在一起。與此同時，火箭隊駕駛著最新研發的「機械阿柏怪沙漠坦克」（簡稱阿柏坦克）現身，這是小次郎動用了三人辛苦積攢的「假裝存款」所打造的強力機械。然而，在火箭隊準備趁隙偷襲皮卡丘時，波克比與幼年尾立不小心闖入無人的坦克駕駛艙，並意外啟動了機械，導致坦克在大失控的狀態下向前狂衝。
大岩蛇攔截行動與尾立的警戒心
小智一行人驚醒後發現波克比失蹤，此時遇見了正在尋找孩子、神情焦急的尾立首領。雙方發現失控的阿柏坦克後，意識到波克比與幼年尾立受困其中。為了營救同伴並阻止機械破壞環境，小智一行人決定與同樣想奪回坦克的火箭隊暫時合作。小剛在此展現了卓越的指揮能力，制定了「阿柏坦克阻截計劃」：利用大岩蛇挖掘大型坑洞，並讓小霞的海星星、蚊香蝌蚪、可達鴨與小智的傑尼龜共同施展水槍將土坑變成泥沼緩衝區。儘管計劃周詳，但坦克的速度卻突然加快，越過了陷阱，朝著附近的城鎮與岩山衝去。
岩山的突破與塞翁失馬的結局
眼看坦克即將撞上堅硬的岩山並可能波及城鎮，尾立首領利用族群特有的鳴叫聲，向遠方的夥伴發出警告，提醒山裡的寶可夢避難。小智見狀立刻派出噴火龍與大岩蛇進行最後的強力攔截。大岩蛇死命咬住坦克的尾部減速，噴火龍則用火焰噴射熔化窗戶玻璃，讓皮卡丘成功救出波克比與幼年尾立。失去控制的坦克最終撞入岩山發生大爆炸，火箭隊也隨之被打飛。正當大家擔心造成破壞時，君莎小姐卻現身向眾人致謝，原來這座岩山一直阻隔著前往桔梗市的交通，坦克的衝撞反而意外開闢了一條隧道，讓居民不再需要遠繞。這場風波最後在意外的驚喜中圓滿落幕，小智一行人也繼續踏上旅程。