成功收服綠毛蟲與同伴間的矛盾
在常磐森林的深處，小智終於靠自己的力量收服了蟲寶可夢「綠毛蟲」，這是他踏上寶可夢大師之路以來，第一次正式收服到野生的寶可夢。小智對此感到雀躍不已，但同行的小霞卻因為極度恐懼蟲子，對綠毛蟲表現出強烈的厭惡感，甚至拒絕讓綠毛蟲靠近。綠毛蟲雖然想跟小霞交朋友，卻被她的尖叫聲嚇得垂頭喪氣。當晚，綠毛蟲向皮卡丘訴說自己想要進化成巴大蝶的夢想，皮卡丘也溫柔地鼓勵著牠。
比比鳥的收服與屬性克制的教訓
隔天清晨，小智在森林中遇到了一隻強力的鳥寶可夢「比比鳥」。小智為了證明綠毛蟲的實力，不顧屬性上的劣勢（飛行系克制蟲系），強行派出綠毛蟲應戰。結果綠毛蟲差點被比比鳥當作食物攻擊，處境極度危險。在小霞的提醒下，小智才意識到自己的判斷錯誤，趕緊換上皮卡丘戰鬥。在皮卡丘的電擊下，小智順利收服了第二隻同伴——比比鳥。然而，小霞嚴厲批評小智不該無視屬性相剋的基礎常識，認為他過於草率的判斷會讓寶可夢陷入危險。
火箭隊的奇襲與綠毛蟲的逆襲
就在此時，火箭隊的武藏、小次郎與喵喵再次現身，他們看中了小智那隻超越一般水平的皮卡丘，決定強行奪取。面對火箭隊派出的阿柏蛇與瓦斯彈，小智的比比鳥因體力消耗而敗北，皮卡丘也被瓦斯彈的墨汁封鎖了視線與行動。陷入絕境的小智，最後只能派出已經負傷的綠毛蟲。火箭隊看不起弱小的綠毛蟲，甚至大聲嘲笑，不料綠毛蟲展現出頑強的鬥志，以強力的「吐絲」招式將阿柏蛇、瓦斯彈與喵喵全身綑綁，成功擊退了火箭隊。
綠毛蟲的進化與未來的冒險
這場戰鬥成了小智的第一場正式勝利，綠毛蟲也贏得了小霞的認可。就在大家慶祝勝利時，綠毛蟲全身發出白光，進化成了「鐵甲蛹」。小智對綠毛蟲（鐵甲蛹）的成長感到無比驕傲。儘管小霞依然對蟲子感到心驚膽跳，但三人一鼠的牽絆也因此加深。帶著新加入的同伴，小智一行人繼續在常磐森林中前進，向著下一個挑戰邁進。