石英高原的抵達與聖火的意義
小智、小霞與小剛終於抵達了舉辦寶可夢聯盟的地點——石英高原。隨著比賽臨近，小智顯得既興奮又緊張。在前往會場的路上，他們偶遇了聖火跑者。小剛解釋，這團聖火是取自傳說中的寶可夢「火焰鳥」，象徵著守護大會與參賽者們的聖火。小智聽聞後深受感動，並對傳說中的火焰鳥充滿了嚮往。
與達馬蘭奇會長的相遇
在聖火傳遞的過程中，小智因為一時興起想要參與聖火跑者的行列而與君莎小姐發生爭執。此時，寶可夢聯盟大會的執行委員長達馬蘭奇會長現身，他認同了小智對寶可夢的熱忱，破例邀請小智擔任聖火跑者。小智手持火炬，深刻感受到了火炬中所承載的勇氣與夢魂，認真地完成聖火傳遞的任務。
火箭隊的阻撓與種火的祕密
一向對珍稀物品充滿野心的火箭隊自然不會放過這個機會，武藏、小次郎與喵喵現身並設下陷阱企圖奪走聖火，打算將其高價轉賣。雖然小智派出了傑尼龜試圖保護火炬，但火箭隊仍透過卑鄙的手段搶走了聖火並逃之夭夭。正當眾人感到絕望時，達馬蘭奇會長從懷中拿出了預備用的「種火」，解釋這是為了預防萬一而保留的原始火焰。在會長的幫助下，聖火得以重新點燃，傳遞任務也順利抵達石英運動場。
選手村的對峙與內心的壓力
當晚，小智一行人入住選手村，在那裡遇到了宿敵小茂。小茂一如既往地冷嘲熱諷，批評小智毫無情報收集能力，並斷言他絕對無法獲勝。這番話讓小智倍感壓力，深夜獨自一人來到寂靜的運動場思考。在那裡，他再次遇到了達馬蘭奇會長，會長給予了他鼓勵，讓小智重新燃起鬥志，決定以自己的方式全力以赴。
開幕式的危機與火焰鳥的奇蹟
開幕式當天，正當最後一名跑者準備點燃大型聖火台時，火箭隊駕駛著巨大的機器人「燃燒者」再度闖入會場，強行奪走了整座聖火台。面對電擊無效且武力強大的機器人，小智不顧危險挺身保護會場，強調這裡是訓練家們賭上尊嚴與夢想的戰場。此時，聖火中突然爆發出驚人的生命力，火焰化作火焰鳥的形狀，瞬間將火箭隊的機器人擊碎，聖火回到了聖火台並劇烈燃燒。在達馬蘭奇會長的開幕宣言下，寶可夢聯盟正式拉開序幕，小智也準備迎接他人生中最重大的挑戰。