預選賽的形勢與對手的出現
城都聯盟白銀大會預選賽進入關鍵階段。在Ｈ組的第一場比賽中，小智憑藉傑尼龜的活躍擊敗了擅長火系寶可夢的小萌，取得了3分積分。隨後，來自若葉鎮的純一在第二場比賽中對上小萌，雖然他派出了水系的瑪力露麗與尼ョロゾ（蚊香蛙），卻不敵小萌火岩鼠的猛烈攻勢，最終小萌也獲得3分積分。這意味著在接下來小智對純一的比賽中，小智只要不輸就能以積分4分晉級十六強，而純一則必須獲勝才有一線生機。
草系寶可夢的衝突與誤會
在比賽前夕，小智一行人遇見了空木博士與純一。純一透露他最初是從空木博士那裡得到菊草葉並展開旅程，如今已進化成大竺葵。與此同時，小智的妙蛙種子、傑尼龜與純一的大竺葵、瑪力露麗在草地上相遇，雙方因口角演變成肢體衝突。就在情況失控時，葉越派出大奶罐使用「治癒鈴聲」平息了紛爭。雖然君莎小姐一度懷疑寶可夢私下鬥毆（這可能導致參賽資格被取消），但在小茂的巧妙解釋下，將衝突化解為一場「練習比賽」，讓小智與純一避開了禁賽危機。然而，小茂依舊對小智落後的寶可夢管理能力冷嘲熱諷，燃起了小智的鬥志。
激烈的預選賽：小智對決純一
比賽正式展開，純一首先派出瑪力露麗，小智則以皮卡丘迎戰。皮卡丘展現了極高的戰鬥技巧，利用「鐵尾」勾住對手的尾巴後，近距離釋放「打雷」擊敗瑪力露麗。然而，純一接著派出了色違的三合一磁怪，這成了小智的噩夢。三合一磁怪利用「電磁波」與「冰凍之風」留下的減速效果，連續擊敗了動作變得遲緩的皮卡丘與火球鼠，讓小智陷入只剩一隻寶可夢的絕境。
妙蛙種子的經驗與尊嚴之戰
小智最後的希望交託給了經驗豐富的妙蛙種子。妙蛙種子展現強大的應變能力，先是以「寄生種子」消耗三合一磁怪的體力，並以「藤鞭」識破其影子分身，成功扳回一城。最終戰由妙蛙種子對決大竺葵。雙方同為草系寶可夢，展開了力量與意志的對碰。大竺葵擁有體型與力量優勢，但妙蛙種子利用靈活的藤鞭使出「過肩摔」反制。比賽末段，雙方捨棄閃避，站在場中以藤鞭正面互抽，這是一場關乎草系自尊的硬戰。最後，兩者同時釋放最強大的「陽光烈焰」，在一陣劇烈爆炸後雙雙倒地無法戰鬥。
晉級決賽圈與命運的宿敵戰
裁判宣判定為平手後，小智在Ｈ組最終以4分總積分脫穎而出，成功獲得進入決賽錦標賽的資格。純一與小萌雖敗猶榮，大方地向小智祝賀並約定未來再戰。就在比賽大會公布決賽圈第一輪的對戰表時，小智赫然發現他接下來的對手，正是他一直以來最想挑戰的宿敵——小茂。兩位來自真新鎮的少年，即將在最高殿堂展開六對六的全力決鬥。