受困於都市風之迷宮的天蠍群
正在前往帷幕市旅行的小智、小光與小剛，在路途中遇到了一群由天蠍王率領的天蠍群襲擊，不僅午餐被搶奪，還差點被捲入混亂中。此時，真司也出現在現場，並試圖捕捉這隻強大的天蠍王。在混亂中，一隻個性稍微笨拙、愛哭且特別親近小智的天蠍引起了大家的注意。這隻天蠍似乎對小智情有獨鍾，不斷地撞向他，展現出與眾不同的性格。
都市建築風帶來的生態危機
根據君莎小姐與喬伊小姐的說明，這群天蠍與天蠍王原本身處森林，卻因暴風雨被強風吹進了這座充滿高層建築的城市。由於城市中存在著強大的「建築風」（大樓間產生的突風），導致擅長滑翔的天蠍們無法順利乘風飛回森林。更糟的是，天蠍王發出的超音波在大樓間亂反射並被增幅，意外地吸引了更多城市外的天蠍聚集。為了導引牠們回到大自然，眾人計畫利用特定的風向路徑，配合寶可夢的招式來製造人工氣流。
真司的冷酷抉擇與火箭隊的攪局
計畫進行到一半時，火箭隊出現並試圖利用機械裝置捕捉天蠍群作為收集糧食的勞動力，但在那隻笨拙天蠍的意外干擾下，火箭隊的裝置損毀，計畫也隨之宣告失敗。然而，殘骸卻堵塞了原本預計的逃生路徑。此時，真司再度現身，派出瑪狃拉與電擊獸以強大的實力壓制並成功捕捉了天蠍王。捕捉成功後，真司冷酷地表示剩下的天蠍對他而言毫無價值，隨即離去，留下失去領導者、陷入恐慌且不知所措的天蠍群。
小智的溫暖引導與新夥伴的加入
為了救助剩下的天蠍，小智決定接手引導工作。他與皮卡丘、草苗龜以及那隻笨拙的天蠍合作，成功將天蠍群帶領到寶可夢中心。在喬伊小姐與多隻巴大蝶施展「烈暴風」招式的幫助下，加上草苗龜純熟的「能量球」控制氣流，終於成功讓天蠍群乘著上升氣流飛向森林。原以為事件就此圓滿落幕，但那隻笨拙的天蠍卻因為捨不得小智而留了下來。感受到天蠍的心意，小智決定收服牠，讓牠成為旅途中的新夥伴。於是，小智在獲得新戰力的同時，繼續朝著下一個道館所在地前進。