神祕的強者與格拉吉歐的現身
故事開頭，骷髏隊的三人組在街頭試圖搶奪一名神祕少年的寶可夢，卻被少年派出的鬃岩狼人（夜晚的樣子）以壓倒性的實力瞬間擊敗。這一幕被路過的火箭隊看在眼裡，他們對那隻散發著強大殺氣的鬃岩狼人感到既畏懼又著迷。與此同時，小智正在與皮卡丘、岩狗狗、火斑喵和木木梟進行晨練，岩狗狗表現出強烈的鬥志與成長。
兄妹重逢與過去的回憶
在寶可夢學校，小智從同學口中聽說了島上出現一位擁有「夜晚的樣子」鬃岩狼人與月亮伊布的神祕強者。隨後，小智在出門幫庫庫伊博士跑腿時，親眼目睹了這名少年——格拉吉歐擊敗了對手的水箭龜。就在小智興奮地提出對戰請求時，莉莉艾意外現身並稱呼少年為「哥哥」，眾人才驚覺這位神祕訓練家正是莉莉艾失蹤半年的親哥哥。管家詹姆斯向小智透露，格拉吉歐曾是一個溫柔的孩子，曾親自救助過受傷的伊布，為了修行才獨自離家。
清晨的約定與激烈的對戰
格拉吉歐得知小智擁有的Z手環是從守護神卡璞・鳴鳴那裡得到的，並且兩人曾交過手，這引起了他的興趣。格拉吉歐透過書信約定小智在清晨的海邊進行對戰。對戰開始，小智派出岩狗狗對抗格拉吉歐的鬃岩狼人。儘管實力懸殊，岩狗狗仍憑藉著對偶像的憧憬與頑強的鬥志不斷進攻，但在鬃岩狼人強大的「尖石攻擊」與「雙倍奉還」面前陷入苦戰。
火箭隊的亂入與強大的Z招式
就在戰鬥關鍵時刻，火箭隊突然駕駛機械亂入，並用捕捉網抓走了皮卡丘與鬃岩狼人。為了救回同伴，受傷的岩狗狗奮不顧身地咬住捕捉網。格拉吉歐隨即派出月亮伊布支援，並決定親自終結鬧劇。他與鬃岩狼人使出了岩石屬性的Z招式「地平天翻大裂斬」，巨大的岩塊將火箭隊連同機械一起炸飛到天際。這股毀天滅地的力量讓小智看得目瞪口呆，也更加堅定了他想要掌握岩石Z招式的決心。
展望未來的目標
戰鬥結束後，格拉吉歐建議小智若想獲得岩石Z純晶，就去挑戰阿卡拉島的大考驗。由於學校上課時間已到，原本的對戰只能暫時作罷。臨別前，格拉吉歐誇獎了小智的岩狗狗擁有跟他的鬃岩狼人一樣堅毅的眼神。雖然莉莉艾遺憾沒能留哥哥回家吃頓飯，但小智已經找到了新的努力方向，準備迎接阿卡拉島的挑戰。