枯葉市的大雪與短暫的返家
由於一場罕見的大雪導致櫻木研究所的系統故障，研究所決定暫時休業進行維護。因此，小智與小豪獲得了難得的假期。小豪聯繫了平時工作繁忙的父母，準備獨自帶著炎兔兒回到家中。在出發前，小智發現小豪不小心掉落了準備送給父母的禮物，但來不及提醒，小豪就已經搭上巴士離去，於是小智決定隨後親自將禮物送到小豪位於公寓的家中。
小豪的家庭背景與孤獨的感觸
小豪回到家後見到了慈祥的奶奶，並得知身為系統工程師與程式設計師的父母因為醫院系統發生故障，正忙於搶修而無法準時回家。小豪雖然表現得十分懂事且習慣獨處，但內心仍渴望家人的陪伴。他決定帶著奶奶煮好的燉菜去醫院探望父母，卻在此時發現自己弄丟了要送給父母的禮物。在穿過公園的途中，小豪與炎兔兒遇到了一隻正在哭泣的卡拉卡拉，它正被一群猴怪欺負，甚至連視為命根子的重要骨頭都被搶走了。
尋找遺失的骨頭與小智的援助
看到卡拉卡拉因為失去親人的痛苦而寂寞哭泣，小豪感同身受，決定召集他之前收服的所有寶可夢，包括巴大蝶、大針蜂、飛天螳螂、傲骨燕等，在雪地中展開大搜索。此時，小智也循著地址趕到公園與小豪會合。兩人合作利用蕉香果引誘出猴怪，並在對戰中取勝。然而，猴怪卻表示骨頭在混亂中掉進了冰冷的池塘裡。小豪隨即派出具有耐寒特性的白海獅潛入池底，終於成功找回了對卡拉卡拉來說意義非凡的骨頭。
溫馨的重逢與新的夥伴
就在事情圓滿解決時，小豪的父母在回家路上正好看見了小豪與寶可夢們努力的身影，一家人終於在雪中團聚。卡拉卡拉被小豪的溫柔與熱心所感動，主動提出想要成為他的夥伴，小豪也順利將其收服。小智隨後將撿到的手套交還給小豪，讓小豪能親手將這份溫暖的禮物送給父母。最後，全家人邀請小智一起回家享用溫暖的燉菜，奶奶也帶著卡拉OK大賽的獎杯凱旋歸來。而在遠處的櫻木研究所，神出鬼沒的耿鬼再度現身，為下一次的冒險留下了伏筆。