抵達瑪納羅競技場與聯盟前奏
小智與寶可夢學校的夥伴們搭船抵達了位於人工島上的「瑪納羅競技場」，這座宏偉的場地是由以太基金會傾盡全力建造，作為第一屆阿羅拉寶可夢聯盟的舉辦地。在庫庫伊博士忙於籌備工作之際，眾人開始探索島上的各項設施。莉莉艾、瑪奧與水蓮前往購物中心，而小智、卡奇與馬瑪內則迫不及待地參觀對戰場地。與此同時，火箭隊三人組也潛伏在會場，偽裝成「瑪納羅甜甜圈」的攤商，企圖藉由販賣甜甜圈籌集資金，同時計畫在聯賽中奪冠以征服阿羅拉。
哈烏現身與骷髏隊的騷擾
在競技場中，小智巧遇了默丹的孫子哈烏。哈烏透露他已經通過了大考驗並獲得Z手環，他的夥伴投羽梟也進化成了狙射樹梟，雙方約定要在聯盟賽中全力以赴。然而，和平的氛圍被骷髏隊的手下打破，塔帕等人因不滿庫庫伊博士舉辦聯盟賽，在會場各處塗鴉、製造混亂並挑釁參賽者。小智、卡奇與哈烏挺身而出，與骷髏隊展開對戰，展現了絕佳的實力與默契。
古茲馬的執念與過去的恩怨
骷髏隊的首領古茲馬與幹部布爾美莉隨後現身。古茲馬冷嘲熱諷地表示，他參加聯賽的目的並非為了夢想，而是為了奪冠後親手廢除聯盟，徹底粉碎庫庫伊博士的理想。島嶼之王哈拉隨後揭露了令人震驚的真相：古茲馬與庫庫伊曾是同門弟子，都曾跟隨哈拉學習。但古茲馬因偏激的性格與對阿羅拉傳統（如Z招式與諸島巡禮）的否定，最終背叛師門並與庫庫伊反目成仇。小智聽聞後，更加堅定了守護聯盟與夥伴夢想的決心，誓言絕不會輸給古茲馬。
前夜祭與震撼的預賽規則
聯賽開幕前夕，會場舉行了盛大的前夜祭，各路強敵紛紛現身，包括大木校長、伊利馬以及格拉吉歐。格拉吉歐再次向小智發出挑戰宣言，讓比賽氣氛達到最高潮。在慶典中，庫庫伊博士邀請了特別嘉賓「皇家蒙面人」宣布第一階段的預賽規則。出乎所有人意料，預賽將採用全體參賽者同時上場的大亂鬥模式——「皇家對戰」，唯有在混戰中最後倖存的16名選手，才能獲得晉級正式決賽錦標賽的門票。第一屆阿羅拉寶可夢聯盟，就在這充滿變數與熱血的氛圍下正式揭幕。