神祕生物的現身與電子工作課
故事開頭提到，從小智一行人從波尼島搭乘的船上，悄悄跟來了一些神祕的小生物。與此同時，在庫庫伊博士的課堂上，學生們正在進行電子工作課，嘗試製作馬瑪內設計的寶可夢訓練裝置。而在火箭隊的祕密基地，武藏、小次郎與喵喵剛買完廉價零件回來，小次郎興奮地展示採購的成果，喵喵卻發現他藏在冰箱裡的「特製布丁百匯」不見了，引發了一場關於誰偷吃零食的小爭執。
課堂上的大發現：鋼鐵食客美錄坦
在製作裝置的過程中，莉莉艾發現了一個形狀像螺帽、手感卻軟綿綿的神祕物體。這個物體突然發射出強力的「鋼砲光澤」並引發小爆炸，眾人這才驚覺這竟然是一種未知的寶可夢。洛托姆圖鑑搜尋不到任何相關數據，顯示這可能是尚未被發表的新物種。馬瑪內發現他們準備的螺帽、螺絲甚至工具的尖端都被這些神祕生物吃掉了。卡奇試圖用在牧場鍛鍊出的技巧安撫牠們，卻意外被美錄坦使出的電屬性招式電得焦黑。經過觀察，大家發現這些生物非常喜歡吃金屬，且對磁力有強烈反應，馬瑪內利用電磁鐵成功吸引了牠們的注意，而卡奇的嘎啦嘎啦也與牠們跳起了歡迎之舞。
火箭隊的危機與小次郎的收藏慘劇
另一邊，一群美錄坦闖入了火箭隊的基地，不僅熔毀並吃掉了他們辛苦買回來的機械零件，還將小次郎視如性命的珍貴瓶蓋收藏給熔毀了大半。悲痛欲絕的小次郎與武藏決定捕捉這些新種寶可夢來發大財，並宣洩瓶蓋被毀的恨意。然而，面對美錄坦的集體反擊，火箭隊的好壞星與迷你Q陷入苦戰。最終，穿著熊與小奶罐一如往常地出現，將火箭隊一行人帶走，中斷了這場衝突。
共鳴的鐘聲與世紀大發現
小智一行人在校園角落找到了正在敲擊大鐘的美錄坦們，發現牠們會與鐘聲產生共鳴，並瘋狂旋轉頭部發出聲音。洛托姆詳盡記錄了牠們的生態數據，包括喜歡吃金屬、喜悅時會搖晃電線般的尾巴、驚訝時會僵住以及能使用電屬性招式等特徵。小智隨後與大木博士通訊，大木博士對此大發現感到非常興奮，並將其視為世紀發現，著手開始分析數據。故事最後，一隻與小智的木木梟建立起奇妙友誼的美錄坦，悄悄跟隨並躲進了小智的背包裡，為未來的冒險埋下伏筆。