馬瑪內與星舟的傳說
在美樂美樂島的竹丘上，馬瑪內與父母一同露營。馬瑪內向托戈德瑪爾與蟲電寶講述了他最喜歡的童話故事「星舟輝夜」：敘述一個從月亮降臨的發光竹筍，被一對老夫婦撫養長大，最後化作星之舟飛回月亮的故事。當晚，馬瑪內意外在竹林中發現了一個埋在地底下的金屬物體，其面貌與故事中的「輝夜」極其相似，於是興奮地認為自己找到了傳說中的星舟。
謎之物體與究極防衛隊的任務
隔天，小智與朋友們來到竹丘協助馬瑪內挖掘。在強顎雞母蟲群的幫助下，眾人挖掘出一個巨大的金屬物體。經過馬瑪內的分析，這個物體已經埋在地底兩百年之久。此時，庫庫伊博士發出緊急出動指令，小智一行人化身為「究極防衛隊」前往處理。經由以太基金會的露莎米奈理事長確認，這個物體正是名為「鐵火輝夜」的究極異獸。根據資料，鐵火輝夜在地底吸收養分並儲存高壓氣體，一旦氣體集滿便會發射起飛，但其強大的噴射熱能可能會將周圍的竹林全部燒毀。
守護竹丘的發射行動
正當究極防衛隊試圖保護現場時，火箭隊出現並試圖捕捉這隻被他們稱為「火箭寶可夢」的鐵火輝夜。由於鐵火輝夜深深扎根於大地，究極球無法將其收服。面對即將噴射起飛的鐵火輝夜與火箭隊的機械騷擾，馬瑪內提出了一個解決方案：建立防禦壁來隔絕熱能。小智與卡奇負責對付火箭隊的喵喵機器人，而莉莉艾、水蓮與瑪奧則指揮騎乘寶可夢與自己的夥伴，利用岩崩、泡沫光線與冷凍光束等招式，在鐵火輝夜周圍築起了一道厚實的冰石防禦牆。
回歸月亮的星舟
最終，鐵火輝夜噴出高壓氣體正式點火起飛。強大的噴射動力將試圖靠近的火箭隊震飛，而預先建好的防禦壁成功阻擋了火焰蔓延，保護了竹林免受燒毀。眾人看著鐵火輝夜如同傳說中的「星舟」一般，在月色中閃耀著綠色光芒飛向外太空。馬瑪內雖然不捨，但也開心地與朋友們一同向這位跨越兩百年時光的訪客道別。這次任務不僅讓鐵火輝夜成功啟程，也守護了阿羅拉地區的自然和平。