新生活的正式開啟與Z手環的秘密
小智與皮卡丘正式加入阿羅拉地區的寶可夢學校，在庫庫伊博士的介紹下，與瑪奧、水蓮、莉莉艾、卡奇及馬瑪內成為同班同學。小智向大家展示了他從美樂美樂島的守護神——卡璞・鳴鳴那裡獲得的「Z手環」，這讓所有人震驚不已。卡奇嚴肅地告誡小智，Z招式是透過訓練家與寶可夢心意合一所產生的神聖力量，並非輕易可以駕馭，持有手環必須具備相應的責任與覺悟。
課堂學習與夥伴們的驚喜歡迎會
在成也・歐基德校長的課堂上，大家學習了阿羅拉地區特有的「地區型態」，了解椰蛋樹等寶可夢如何因氣候環境進化出不同的樣貌。隨後，為了歡迎小智，同學們精心籌備了驚喜歡迎會，設計了三場挑戰：第一場是與馬瑪內及托戈德瑪爾進行戳氣球比賽，小智因托戈德瑪爾的「避雷針」特性而落敗；第二場是與水蓮及球球海獅進行海上競速，展現了水蓮高超的游泳默契；第三場則是與卡奇進行肯泰羅賽跑。雖然小智在各項挑戰中未能獲勝，但他已迅速融入了群體。
卡璞・鳴鳴現身與Z招式的覺醒
正當庫庫伊博士準備與小智進行對戰練習時，卡璞・鳴鳴突然現身並搶走小智的帽子，將他引導至空曠處發起挑戰。在對戰中，卡璞・鳴鳴展開了「電氣場地」，並引導小智與皮卡丘觸發Z手環中的「電氣Z」。小智與皮卡丘心領神會，使出了全力的電氣屬性Z招式——「終極伏特狂雷閃」，爆發出驚天動地的威力。雖然招式成功發動，但由於小智尚未通過試煉，電氣Z純晶在招式結束後隨即碎裂。
全新的目標：挑戰諸島巡禮
經歷了與守護神的對戰，小智深感自己與皮卡丘的力量仍有不足，若要正確使用Z招式，必須正式參加阿羅拉地區的傳統儀式「諸島巡禮」。在同學們的鼓勵與支持下，小智立志要挑戰各島嶼的考驗以獲取全新的Z純晶。最後，庫庫伊博士贈送給小智一台全新的寶可夢圖鑑，為他在阿羅拉地區的冒險旅程開啟了充滿希望的新篇章。