重建密阿雷市與希特洛伊特的重啟
在與閃焰團的激烈戰鬥結束後，小智一行人留在密阿雷市協助災後的重建工作。希特隆努力修復在戰鬥中為了阻止系統而犧牲的機器人「希特洛伊特」。雖然希特洛伊特成功重新啟動，但遺憾的是，原本的記憶已經完全被消去，變回了初次見面時的初始狀態。希特隆雖然感到傷感，仍堅強地與這位重要的夥伴重新建立關係，對它說：「我是你的主人希特隆，請多指教。」與此同時，火箭隊向坂木老大匯報了閃焰團覆滅的消息，並將功勞攬在自己身上。為了在回歸關都本部前立下更大的功勞，他們密謀要在離開前奪走小智的皮卡丘作為賀禮。
挑戰者阿爾巴與艾嵐的救贖
一位名為阿爾巴的年輕訓練家來到尚未正式對外開放的密阿雷道館。他透露自己曾在之前敗給希特洛伊特，因此拼命特訓，希望能再次挑戰它以獲得徽章。希特隆在說明情況後，答應讓失去記憶的希特洛伊特與他進行一場對戰。隨後，艾嵐在布拉塔諾博士的陪同下回到了研究所，瑪農與小智一行人特地為他舉辦了驚喜慶祝派對。派對中，小智表示自己決定回到真新鎮，從零開始重新修行。而艾嵐則因曾被閃焰團利用、對大眾造成傷害而深感愧疚，小智以「與艾嵐的對戰非常快樂」來鼓勵他，並與他約定未來一定要再度對戰，這番話成功讓艾嵐從陰霾中解脫。
道館對戰與希特洛伊特的新篇章
隔日，密阿雷道館舉行了重啟後的第一場非正式賽。由阿爾巴對抗代理道館館主希特洛伊特。對戰中，希特隆指導希特洛伊特如何觀察對手並預測行動，雖然阿爾巴展現了強大的實力，先後擊敗了希特洛伊特的磁怪與三合一磁怪，但在最後的對決中，希特洛伊特的光電傘蜥雖奮力迎戰，最終仍不敵阿爾巴的卡拉卡拉。阿爾巴成功獲得了電壓徽章，這場戰鬥也讓希特洛伊特體會到了落敗的悔恨與戰鬥的熱趣，它請求希特隆教導它更多關於寶可夢的事情，兩人的關係在全新的起點上重新出發。
英雄們的榮耀與各自的未來
戰後，布拉塔諾博士在研究所為大家補辦了卡洛斯聯盟的表彰儀式。不僅是獲得亞軍的小智與冠軍艾嵐，所有為了守護卡洛斯地區而奮戰的夥伴與寶可夢們都獲得了象徵英雄榮耀的獎牌。艾嵐也接受了博士的邀請，決定留在研究所協助研究。隨著夜幕降臨，密阿雷市的稜鏡塔重新點亮，象徵著和平的回歸。小智一行人在璀璨的光芒下，各自對未來許下了承諾。最後，莎莉娜對於八汐小姐先前的演藝邀請仍感到猶豫，每個人都在這道光芒下，準備迎接屬於自己的下一段旅程。