巔峰對決：皮卡丘的謝幕與黏美龍的奮戰
在卡洛斯聯盟決賽的激戰中，小智與阿蘭的對決進入了後半程。小智的皮卡丘在與阿蘭的噴火龍交手中，雖然成功使出十萬伏特造成傷害，但因之前的戰鬥累積了大量疲勞，最終在噴火龍的龍之爪攻擊下失去戰鬥能力。隨後，小智派出了黏美龍，而阿蘭則換下噴火龍，派出劈斬司令應戰。小智利用黏美龍的「求雨」將場地變為有利環境，並採取「忍耐」戰術試圖反擊，然而劈斬司令以強大的攻擊力配合「斷頭鉗」一擊必殺，黏美龍遺憾敗北。
連鎖反應：甲賀忍蛙的強勢突破
面對只剩最後一隻寶可夢的絕境，小智派出了王牌甲賀忍蛙。得益於黏美龍留下的雨天效果，甲賀忍蛙的水屬性招式威力大增，配合影子分身迅速迷惑對手，以強力的水之手裡劍擊敗了劈斬司令。此時雙方皆剩下最後一隻寶可夢，阿蘭再度派出噴火龍，場上雨過天晴，雙方的最強王牌即將展開最終的命運對決。
極致對抗：小智版甲賀忍蛙對決超級噴火龍Ｘ
戰鬥進入白熱化，小智與甲賀忍蛙發動人機合一的「羈絆進化」，變身為小智版甲賀忍蛙；阿蘭則透過鑰石與超級石，讓噴火龍超級進化為超級噴火龍Ｘ。雙方展開了高水準的攻防，燕返、居合斬與噴火龍的龍之爪、雷電拳激烈碰撞。阿蘭坦言在這場戰鬥中感受到了前所未有的樂趣，但為了守護重要的事物，他發誓必須成為最強。最後一刻，甲賀忍蛙凝聚了全身力量形成巨大的黃金水之手裡劍，與噴火龍的爆炸烈焰產生劇烈爆炸。濃煙散去後，甲賀忍蛙支撐不住倒下，阿蘭贏得了卡洛斯聯盟的總冠軍。
榮耀與陰謀：卡洛斯地區的突發異變
雖然遺憾落敗，小智展現了運動家精神，與阿蘭互相致意並承諾會變得更強。就在頒獎典禮進行時，潛伏在密阿雷市的閃焰隊首領弗拉達利啟動了最終計劃。他們利用收集到的超級進化能量控制了基格爾德的核心（Z2），使其失控並在稜鏡塔頂端暴走，釋放出巨大的紅色植物瞬間破壞並佔領了密阿雷市。小智、阿蘭以及所有觀眾驚覺事態嚴重，原本和平的聯盟大賽瞬間演變成威脅整個卡洛斯地區的災難，故事進入了最緊張的閃焰隊篇章。