火箭隊的襲擊與意外的地下迷途
小智、莎莉娜、希特隆與柚莉嘉一行人正朝著百刻道館繼續旅行。途中，火箭隊突然現身並利用特殊的絕緣網抓走了皮卡丘，但在希特隆的掘掘兔使用泥巴射擊干擾，以及皮卡丘的十萬伏特反擊下，火箭隊再次被打飛。然而，爆炸的衝擊讓地面崩塌，小智一行人跌入了深不見底的舊廢棄礦坑。在尋找出口的過程中，看著眼前的廢棄鐵軌，柚莉嘉想起了希特隆與掘掘兔最初相遇的故事。
希特隆與掘掘兔的初次相遇
故事回到希特隆被自己製作的機器人「希特羅伊特」趕出密阿雷道館後的那段日子。當時垂頭喪氣的希特隆與柚莉嘉正為晚餐發愁，一隻野生的掘掘兔突然出現並搶走了他們的蘋果。兩人一路追趕，意外進入了密阿雷市廢棄的地鐵站，發現這隻掘掘兔是為了分享食物給一群生活在廢棄電車上的寶可夢。這群寶可夢包括向尾喵、蛇紋熊等，正受到一隻強大且粗魯的掘地兔欺負，掘地兔企圖獨佔這部電車作為領地，並將原本居住在此的寶可夢趕走。
特訓與奪回領地的戰鬥
掘掘兔為了守護夥伴與家園，挺身對抗體型懸殊的掘地兔，卻被打得遍體鱗傷。希特隆深受感動，主動幫掘掘兔包紮傷口，並發揮身為道館館主的專業，教導掘掘兔如何運用靈活的動作來彌補力量的不足。希特隆與柚莉嘉甚至親自下場演戲，指導掘掘兔利用「挖洞」和「影子分身」來閃避攻擊，並善用那雙強壯的大耳朵進行防禦與反擊。在之後的重賽中，掘掘兔成功運用特訓的成果擊敗了掘地兔。最終，兩隻寶可夢冰釋前嫌，在希特隆的見證下握手言和。
守護家園的最後任務
正當大家慶祝勝利時，廢棄車站突然開始劇烈震動，原來車站即將拆遷。為了守護夥伴們喜愛的電車家園，希特隆提出將整部電車移動到安全地點的計劃。他拿出發明「慢跑發電機」，由掘掘兔、掘地兔與其他夥伴共同奔跑發電，希特隆則負責駕駛。儘管途中遇到軌道堵塞與轉轍器故障，但在兩隻兔寶可夢的默契配合下，終於成功將電車開到了陽光普照、充滿果樹的新綠地。完成任務後，掘掘兔在夥伴們的鼓勵與送別下，決定跟隨希特隆，正式成為他的第一隻非電屬性的夥伴。
重回地面與羈絆的延續
回到現實，希特隆感性地表示，正因為有了掘掘兔的幫助，後來才能成功奪回密阿雷道館。隨後，掘掘兔使用挖洞破開了礦坑出口，大家終於重新回到了地面。柚莉嘉最後還爆料當時希特隆在掘掘兔入隊時感動得大哭，讓希特隆尷尬地急忙否認，小智與莎莉娜則在一旁溫暖地笑著。這段回憶讓希特隆與掘掘兔的羈絆更加深厚，一行人重新整理心情，繼續邁向百刻市的旅程。