回到故鄉「龍之里」
為了參加即將在檜垣市舉行的合眾聯盟，小智、艾莉絲與天桐三人正持續展開旅程。在前往目的地的途中，他們決定順道拜訪艾莉絲的故鄉——「龍之里」。艾莉絲帶著愉快的心情向小智與天桐介紹這個充滿龍屬性寶可夢的聖地。在這裡，艾莉絲遇見了兒時玩伴菖蒲，她目前正負責照顧兩隻如同兄弟般的雙首暴龍。隨後，三人前往拜見村裡德高望重的老奶奶，艾莉絲向大家展示了她的成長，並介紹了旅途中收服的夥伴。
老奶奶的智慧與快龍的騷動
艾莉絲喚出快龍後，快龍立即展現出強烈的好勝心，與當地的雙斧戰龍發生對峙，現場氣氛一度緊張。面對情緒激動的快龍，老奶奶以溫和且精準的手法安撫了牠，並看穿快龍是因為擁有強大力量而在旅途中歷經苦楚。老奶奶的教導讓小智與天桐深感佩服，也讓艾莉絲體會到與龍屬性寶可夢溝通的深奧。與此同時，雙龍市的體育館館主夏卡也悄悄來到村子，在暗處觀察著艾莉絲的表現，想確認她自作主張離開學校後的成長成果。
三首惡龍的進化與暴走
眾人在菖蒲的牧場享用午餐時，原本食慾不振的一隻雙首暴龍突然開始進化，成為了強大的三首惡龍。然而，進化後猛然增強的力量讓三首惡龍陷入驚慌與失控狀態，開始在村子裡四處破壞。面對這突如其來的危機，艾莉絲決定挺身而出。儘管小智與天桐想要幫忙戰鬥，但老奶奶阻止了他們，要求眾人相信艾莉絲的意志，並觀察她如何以「龍之大師」為目標處理這場騷動。
艾莉絲的決心與夏卡的挑戰
艾莉絲在牙牙、龍頭地鼠、快龍與導電飛鼠的協助下，將三首惡龍引導至合適的地點。她不顧自身安危，正面承受三首惡龍的攻擊與啃咬，溫柔地擁抱並安撫牠，告訴牠這股力量是進化的證明。三首惡龍感受到艾莉絲的真心，終於恢復冷靜。這場表現讓在場的所有人讚嘆不已，夏卡館主也現身承認了艾莉絲的進步，並正式邀請她前往雙龍體育館進行對戰。受到艾莉絲的激勵，菖蒲也決定等第二隻雙首暴龍進化後便踏上旅程。為了迎接與夏卡的對戰，小智一行人隨即朝著雙龍市出發。