特訓中的意外相遇
為了準備即將到來的合眾聯盟，小智在竹蘭的別墅中持續與滑滑小子進行特訓。然而在特訓過程中，滑滑小子的「氣合彈」不慎擊碎岩石，碎片飛向了路過的毛頭小鷹。毛頭小鷹誤以為是旁邊的禿鷹小子所為，兩隻寶可夢隨即發生激烈爭吵。這時，一位名叫蕾拉的新人老師匆忙趕來，揭露了這兩隻寶可夢其實是來自附近的寶可夢保育園。
天桐的蘇眉師觀察
來到保育園後，眾人發現蕾拉老師雖然充滿熱情，但個性有些冒失且容易跌倒。身為A級寶可夢蘇眉師的天桐觀察到毛頭小鷹與禿鷹小子之間存在著緊張的「風味」，便主動提出幫忙。在保育園照顧寶可夢的過程中，由於蕾拉老師忘記處理堅果的外殼，導致保育園的其他寶可夢發生不快，禿鷹小子為了幫老師出氣而教訓了其他同伴，卻反被蕾拉老師責備。感到委屈且嫉妒蕾拉老師特別呵護毛頭小鷹的禿鷹小子，隨即負氣離家出走。
森林中的危機與救援
禿鷹小子在森林中不幸誤闖了敗露球菇的領地並遭到圍攻。蕾拉老師、天桐與隨後趕到的毛頭小鷹展開救援行動。在逃跑過程中，眾人被困在懸崖邊，且唯一的吊橋也毀壞了。幸好小智及時趕到，指揮炒炒豬利用樹幹搭建臨時木橋。然而在渡橋時，毛頭小鷹與禿鷹小子不慎墜落，蕾拉老師在危急時刻奮不顧身地抓住牠們。這一舉動讓兩隻寶可夢深深感受到老師對牠們不偏不倚的愛，終於化解了彼此的心結。
美洛耶塔的歌聲與火箭隊的陰謀
事件平息後，保育園恢復了往日的和諧，美洛耶塔也現身唱出溫暖心靈的旋律，讓大家充滿了力量。然而在平靜的背後，火箭隊的賽格博士已完成了美洛耶塔的相關數據收集，坂木老大也親自抵達合眾地區，預告著一場針對美洛耶塔的巨大陰謀即將正式展開。