與寶藏獵人麥可的相遇
小智、小光和小剛正搭船前往神奧聯盟的舉辦地——鈴蘭島。在航行途中，小光的波加曼意外撞到了少年麥可的天秤偶。麥可向眾人透露自己是一名寶藏獵人，並展示了一張從沉船中獲得的寶藏地圖，地圖標示著在即將停靠補給的蒲公英島上隱藏著海賊的寶藏。雖然地圖上畫著雷電球、榛果球等寶可夢的圖案讓眾人感到困惑，但在麥可的邀請下，小智一行人決定協助他展開這場尋寶冒險。
充滿陷阱的尋寶之路
抵達蒲公英島後，眾人發現地圖上的寶可夢圖案其實是守護寶藏的「陷阱」。他們先後遭遇到雷電球群的電擊與榛果球群的自爆攻擊。隨後在森林中，成群的霸王花與臭臭花散發出能讓波加曼麻痺的粉末，小智及時派出烈焰猴化解危機。與此同時，火箭隊也偷聽到了寶藏的消息，一路尾隨並妄想奪取財寶，卻同樣被這些寶可夢陷阱整得狼狽不堪。在進入山洞後，眾人遇到隆隆石群的滾動攻擊一度走散，最後在天秤偶與小智的圓陸鯊引領下順利會合，抵達了地圖標示的遺跡。
遺跡守護神念力土偶
眾人來到遺跡深處，發現牆上繪有地圖上提到的太陽岩與月石壁畫。此時火箭隊突然現身企圖強搶寶藏，卻意外啟動機關，喚醒了古代泥偶進化而成的守護者——念力土偶。念力土偶擁有強大的實力，不僅能使用光牆彈開波加曼與土台龜的攻擊，還以強力的射線將火箭隊擊飛。麥可決定發揮其實力，指揮天秤偶利用靈活的速度使出暗影球與旋轉球與其周旋，最後在關鍵時刻收服了這隻強大的念力土偶，成功化解了遺跡的威脅。
寶藏的真相與夢想
當遺跡密室開啟後，出現在眾人眼前的並非金銀珠寶，而是許多古老的陶器。面對小智等人的疑惑，麥可興奮地解釋這才是真正的「寶藏」，並透露自己的夢想是成為一名考古學博士，這些陶器具有極高的考古價值。冒險結束後，麥可決定前往硬山尋找下一個傳說，而小智一行人也抵達了鈴蘭島。隨著神奧聯盟即將開幕，小智與皮卡丘充滿鬥志地迎接接下來的挑戰。