波加曼的過度勞累與夥伴的自責
在前往神和鎮的旅途中，小光為了即將到來的華麗大賽，帶著波加曼進行高強度的特訓。然而，波加曼在完成華麗的「啄」攻擊後突然體力不支倒地。小智、小光與小剛趕忙將牠送往最近的寶可夢中心。經過喬伊小姐的診斷，波加曼只是因為過度疲勞並無大礙，但這讓身為夥伴的小光感到非常自責，認為自己沒有察覺到波加曼的疲憊。而在波加曼休息期間，小智透過視訊向大木博士請教天蠍王的培育建議，大木博士除了提供戰術指導，還鼓勵小光在寶可夢中心與其他協調訓練家進行資訊交換，這讓小光重拾信心，開始向其他訓練家學習冰伊布的美容護理技巧。
火箭隊的「原點回歸」大計
另一邊，火箭隊的三人組在經歷了寶可夢夏令營的打工生活後，發現自己因為生活太過安逸、三餐溫飽而變得身材圓潤，甚至連性格都變得「太過善良」。武藏對此感到震怒，認為火箭隊必須保持冷酷與飢渴的精神，於是提議「原點回歸」。他們決定變賣夏令營賺來的所有打工費，打造一台充滿初心的「原點回歸機械」，並發誓要潛入寶可夢中心盜取所有的精靈球，以此找回惡之組織的榮耀。
混亂的精靈球失竊事件
火箭隊趁夜潛入寶可夢中心的保管庫，打算將精靈球一網打盡。剛好甦醒的波加曼撞見了正在行竊的喵喵，雙方發生衝突，動靜驚動了小智一行人。面對質問，火箭隊不僅換回了初代的經典登場台詞，更駕駛著巨大的「原點回歸機械」登場。這台機器威力驚人，不僅能發射「超級坂木老大飛彈」，力量與速度也讓小智與小光陷入苦戰。武藏與小次郎對這台強大的武裝感到非常滿意，認為自己終於回歸了惡之本色。
意想不到的弱點與旅程的持續
正當火箭隊以為勝券在握時，小智命令皮卡丘發動「十萬伏特」。沒想到，這台斥巨資打造的機械竟然完全沒有做防電處理。喵喵解釋這是為了徹底追求「原點回歸」，因為火箭隊最初的機械確實都沒有防電裝置。由於這個荒謬的堅持，皮卡丘的電擊直接導致機械大爆炸，火箭隊再次化作星光消失在天邊。事件解決後，被盜的精靈球悉數找回，喬伊小姐對小智等人的正義感表示感謝。波加曼康復後也重新振作，與小光等人帶著更深的羈絆，繼續朝著下一個目的地前進。