失利後的反思與特訓
小智在先前與對戰塔大君莉拉的對戰中慘敗，因為莉拉能透過心靈感應向寶可夢發出無聲的指令，讓小智完全無法預測對手的行動，導致皮卡丘、龍蝦小兵與肯泰羅全數落敗。在寶可夢中心休養後，小智深感自己未能發揮寶可夢的全力，決定不更換參戰陣容，直接發起再挑戰。他與寶可夢們透過特訓與玩耍來加深默契，期間雖然不慎驚動大針蜂群而掉入河中，卻也因此與莉拉再次碰面。眾人一起清洗肯泰羅並愉快相處，莉拉向小智分享了如何傾聽大自然與寶可夢心聲的秘訣，讓小智體會到「心靈開放」的重要性。
對戰塔的重賽：戰況膠著
在擊退企圖搶奪食物的火箭隊後，小智與莉拉的3對3再戰正式開始。首戰小智依舊派出龍蝦小兵對抗胡地，胡地利用「自我再生」與「幻象光線」讓龍蝦小兵陷入混亂。小智機智地將龍蝦小兵收回球中再重新派出以解除混亂，最終龍蝦小兵以蟹鉗錘與泡沫光線擊敗胡地。然而，莉拉隨後派出的巨金怪展現出強大的防禦與攻擊力，迅速擊潰了體力透支的龍蝦小兵。小智接著派出肯泰羅，兩隻重量級寶可夢展開激烈的肉搏戰，在「破壞光線」與「突進」的互相碰撞下，最終肯泰羅與巨金怪雙雙倒下，雙方都僅剩最後一隻寶可夢。
決勝負！皮卡丘對戰太陽伊布
最後一戰由皮卡丘對抗莉拉的王牌——太陽伊布。太陽伊布不僅速度驚人，還能透過體毛感應空氣流動來預測皮卡丘的動作，其使出的「電磁炮」更給予皮卡丘巨大壓力。在苦戰中，小智展現了出色的臨場反應，讓皮卡丘在高速移動中製造混亂，干擾太陽伊布的感知，進而打斷了莉拉與寶可夢之間的心靈感應。小智抓住太陽伊布動搖的瞬間，命令皮卡丘使出「伏特攻擊」正面突破電磁炮，成功擊敗太陽伊布。小智最終獲得了第六個開拓象徵「能力象徵」。賽後，亞希達告知最後一個設施「對戰金字塔」位於尼比市附近，小智告別莉拉，朝向最終的制霸目標邁進。