前往釣魚名所放鬆心情
在前往下一個對戰開拓區設施「對戰巨蛋」的旅途中，小智為了讓皮卡丘掌握新招式「伏特攻擊」而陷入苦戰。看到小智過度特訓，小剛與小勝提議前往附近的釣魚名所散心。然而，當眾人抵達湖邊時，卻發現原本熱鬧的湖泊變得荒涼冷清。在嘗試釣魚的過程中，小智意外釣起了一隻性格兇猛的鐵螯龍蝦，並派出了龍蝦小兵與其交戰。就在雙方僵持不下時，一位名為阿彩的少女出現並制止了紛爭。
湖泊背後的收購陰謀
阿彩向小智一行人解釋，這座湖泊曾被傳說有哈克龍居住，風景如畫且深受釣客喜愛。然而，大約一年前「淚橋產業」的淚橋先生為了將此地開發成大型休閒樂園，要求阿彩撤離。自從阿彩拒絕後，湖中就出現了那隻鐵螯龍蝦到處搗亂，趕走了其他的寶可夢與釣客。淚橋先生隨後現身並提出挑戰，要求以一場對戰決定湖泊的歸屬權：若他獲勝，阿彩就必須交出湖泊與小屋。為了守護湖泊，小智代表阿彩接受了這場挑戰。
久雨婆婆的特訓與領悟
阿彩的祖母久雨婆婆觀察了小智的戰鬥方式，認為他只會靠力量硬拚，無法戰勝強大的對手。久雨婆婆派出自己的水伊布與小智進行指導賽，利用水伊布能融入水中的特性，以及湖中茂密的水草地形將龍蝦小兵困入困境。久雨婆婆告誡小智，在對戰中必須臨機應變，充分利用地形與環境。小智深受啟發，隨即帶著龍蝦小兵展開針對地形利用的特訓。
關鍵對戰與火箭隊的介入
決戰當天，小智的龍蝦小兵再次對上淚橋的鐵螯龍蝦。這次小智巧妙地利用湖泊地形進行防守與反擊，雙方戰得旗鼓相當。此時，原本偽裝成樂園設計師的火箭隊突然現身，駕駛強大機械趁亂捕捉了鐵螯龍蝦與皮卡丘。小智與阿彩等人立即追擊，小遙的傑尼龜也在戰鬥中展現出成長，使出「高速旋轉」立功，最終眾人合力擊飛火箭隊，成功救回被抓走的寶可夢。
傳說中的救命恩人
火箭隊的機械爆炸導致淚橋先生落入湖中，並再次陷入多年前險些溺水的恐怖回憶。就在淚橋絕望之際，傳說中的哈克龍突然現身將其救起。淚橋這才驚覺，多年前在湖中救了他的並非奇蹟，正是這隻他一度憎恨的湖泊守護者——哈克龍。感受到哈克龍的善意，淚橋先生為自己的自私深感慚愧，當眾宣布取消開發計畫。隨著和平回歸，原本離開的寶可夢們紛紛回到湖中，湖泊重現往日的生機。小智一行人告別阿彩與久雨婆婆，繼續邁向對戰巨蛋的挑戰。