重逢與失落的珍珠
正當小智、小遙、小剛與小勝為了參加豐緣聯盟，搭船前往綠嶺市的途中心經過瑞弗雷島時，他們在海上再次遇見了那隻愛找東西頂在頭上的跳跳豬。然而，跳跳豬在登船過程中不小心發生碰撞，導致它頭上最重要的珍珠掉入了大海。看到跳跳豬陷入極度沮喪，煤炭龜也感同身受地難過落淚。小智一行人決定幫忙尋找珍珠，並派出了龍蝦小兵、水躍魚與蓮帽小童進行水下搜索，卻始終未能尋獲。
珍珠貝的奧秘與青色珍珠
失去珍珠的跳跳豬開始焦慮地將路邊看到的露力麗、青綿鳥、飄浮泡泡甚至是吼吼鯨頂在頭上當作替代品，讓眾人既無奈又擔心。隨後，他們遇見了正在研究珍珠貝的伊崎博士，並得知跳跳豬頭上的珍珠其實是由珍珠貝孕育而成的。在博士的研究所中，跳跳豬意外發現了一顆極為罕見且珍貴的「青色珍珠」，隨即利用念力將其據為己有並跑出研究所。躲在一旁的火箭隊三人組見狀，也起了貪念，決定奪取這顆珍貴的珍珠。
混亂的珍珠交換與火箭隊的介入
跳跳豬在外面玩耍時不小心絆倒，導致頭上的青色珍珠飛出，恰巧掉進了一隻野生珍珠貝的殼中，而珍珠貝原本的普通珍珠則反彈到了跳跳豬頭上。這一幕被火箭隊看在眼裡，他們隨即偽裝成清潔工誤導小智等人，並趁機捕捉了那隻含著青色珍珠的珍珠貝。火箭隊嘗試各種方法，包括讚美、搔癢甚至讓風鈴鈴唱歌，試圖讓珍珠貝打開殼，但珍珠貝防禦心極強，始終緊閉雙殼並以水槍猛烈反擊。
森林蜥蜴與跳跳豬的聯手反擊
靠著大王燕的引路，小智一行人及時趕到現場。面對火箭隊的威脅，小智派出森林蜥蜴應戰。戰鬥中，跳跳豬展現了強大的念力保護珍珠貝，並支援森林蜥蜴。森林蜥蜴以敏捷的身手使出電光一閃與葉刃重創對手，隨後珍珠貝也使出了強力的極光束，將火箭隊徹底擊飛。戰鬥結束後，珍珠貝感受到跳跳豬的善良與努力，主動歸還了青色珍珠。伊崎博士順利取回研究材料後，珍珠貝也將自己的一顆珍珠贈送給跳跳豬。跳跳豬終於再次獲得了專屬的珍珠，小智一行人也告別了伊崎博士，繼續踏上前往綠嶺市的旅程。