重逢圓朱市與成長的太陽伊布
小智、小霞與小剛在前往卡吉鎮的旅途中，再次回到了圓朱市。在那裡，他們與曾有一面之緣的舞妓姐妹么女——櫻花重逢。櫻花的伊布現在已經進化成了太陽伊布，並展現出能透過空氣流動預測天氣與對手行動的特殊能力。為了測試櫻花的實力，小霞提出進行一場寶可夢對戰，由小霞新收服的太陽珊瑚對上櫻花的太陽伊布。儘管太陽伊布展現了驚人的速度與靈活性，但最終小霞憑藉著太陽珊瑚的「自我再生」技能穩住戰局，贏得了這場比賽。櫻花雖然戰敗，卻也從中體會到自己與太陽伊布仍有進步的空間。
火箭隊的陰謀與舞妓姐妹的危機
與此同時，火箭隊的武藏、小次郎與喵喵偽裝成著名的舞蹈老師，誘騙圓朱市的舞妓姐妹——皋月、小桃、玉緒和小梅前往學習所謂的「寶可夢流」舞蹈。趁著姐妹們放鬆警惕並進行特訓時，火箭隊強行奪走了她們的雷伊布、水伊布、月亮伊布與火伊布。火箭隊企圖湊齊伊布的所有進化形以立下大功，卻發現唯獨缺少了櫻花的太陽伊布。發現寶可夢被搶走後，小智一行人立刻與焦急的姐妹們會合，利用小剛的叉字蝠展開空中搜索。
大膽的誘餌計畫與奪回對戰
櫻花主動提出讓太陽伊布擔任誘餌，利用火箭隊想要湊齊最後一隻進化形的心理，成功引誘出躲藏的火箭隊並找到了他們的藏匿點。面對火箭隊，櫻花展現了堅強的意志，與小霞聯手展開反擊。太陽伊布發揮了精湛的戰鬥技巧，以電光一閃、高速星星和幻象光線重創火箭隊的阿柏怪與大食花。隨後小智的皮卡丘補上十萬伏特，將火箭隊擊飛，成功奪回了所有被偷走的寶可夢。經此一役，姐妹們對櫻花的實力大為改觀。
獨立的覺悟與嶄新的旅程
看到櫻花與太陽伊布在實戰中的成長，姐妹們終於同意讓櫻花獨自外出旅行磨練。雖然小霞熱情邀請櫻花與他們同行，但櫻花婉拒了。她認為如果跟著小智他們，自己會產生依賴心，因此決定先靠自己的力量獨自前往桔梗市挑戰。最後，小智一行人與櫻花在夕陽下道別，彼此約定在未來的旅途中再次相見。櫻花帶著太陽伊布，正式踏上了屬於她自己的修行之路。