抵達水系寶可夢的聖地：荒玉池
小智、小霞與小剛在前往淺黃市的旅途中，來到了風景優美的「荒玉池」。對於熱愛水系寶可夢的小霞來說，這裡的寶可夢中心是她心目中的夢想聖地。眾人在池邊遇見了正在救助角金魚的喬伊小姐，小剛一如既往地展現出熱情，而小霞則對這位傳聞中的喬伊小姐深感崇拜。
荒玉池的歷史與喬伊家族的傳承
喬伊小姐向大家介紹了荒玉池的背景。五十年前，這裡曾是充滿工業廢水的泥沼，連臭泥都無法生存。喬伊小姐的祖母撰寫了著名的《沒有寶可夢的春天》揭露污染問題；隨後她的母親接手環境復育，撰寫了《臭臭泥歌唱之夏》，並成功將此處轉變為水系寶可夢的康復中心。這座中心目前利用不同性質的水質，為瑪瑙水母、白海獅、海刺龍等受傷的寶可夢進行先進的復健治療。
意想不到的秘密：討厭水系的喬伊小姐
正當小霞興奮地想請喬伊小姐為她的水系寶可夢進行健康檢查時，喬伊小姐卻露出了極度恐懼的表情。原來，這位身處水系聖地的喬伊小姐竟然極度討厭水系寶可夢。為了進行診療，她必須穿上厚重的特製橡膠防護服。這源於她童年時的一次心理陰影：當時池中鐵砲魚大量發生，年幼的她不慎掉入水中，被無數鐵砲魚包圍的經歷讓她至今仍對水系寶可夢感到不適與害怕。儘管如此，她仍堅持身為醫者的使命，認為救治病患不應受個人喜好影響。
火箭隊的奇襲與機械毒刺水母
就在眾人交流時，火箭隊駕駛著巨大的「機械毒刺水母」潛入中心企圖奪取寶可夢。雖然機械設備使用了絕緣的橡膠材質，但武藏、小次郎和喵喵卻因為全身濕透而成了導電體。小智指揮皮卡丘發動十萬伏特，強大的電流透過水傳導，直接將火箭隊擊飛，但也因此造成中心的設施受損，讓正在接受治療的暴鯉龍陷入驚恐與憤怒。
超越恐懼的醫德：救治受傷的暴鯉龍
受驚的暴鯉龍在池中劇烈掙扎，若不即時安撫並固定傷處，傷勢將會惡化。在防護服被水沖走、情況緊急之下，喬伊小姐克服了內心巨大的恐懼，徒手接近性格兇猛的暴鯉龍。她憑藉專業知識找到了能讓暴鯉龍平靜的穴位，並在吉利蛋們的協助下成功為其裝上石膏。雖然事後喬伊小姐因壓力過大而昏倒，但她展現出的專業精神讓小霞深受感動。最後，小智一行人告別了這位勇敢的喬伊小姐，繼續踏上前往淺黃市的旅程。