與溫泉專家的偶遇
小智、小霞、小剛與寶可夢攝影師阿徹在追尋傳說中的寶可夢「急凍鳥」的旅途中，於山間休息野餐。這時，三隻可愛的「小山豬」突然出現並搶走了小霞的飯糰。隨後，小山豬的主人美紀夫和他的女兒小雪現身，向眾人解釋美紀夫是一名專業的「溫泉挖掘師」。他利用三隻分別名叫「嗚」、「利」、「姆」的小山豬敏銳的嗅覺來尋找溫泉，並搭配隆隆岩進行開挖，然而他們在此地已經努力了一個月卻始終沒有收獲，糧食也快要耗盡。
火箭隊的溫泉野心
隱藏在旁的火箭隊聽聞小山豬尋找溫泉的能力後，幻想著能藉此開一家溫泉民宿發大財，於是假扮成受公司委託的挖掘幫手混入其中。武藏與小次郎一邊假裝幫忙，一邊尋找機會。趁著眾人休息時，火箭隊利用特製的「滑溜溜油」和陷阱成功誘拐了三隻小山豬。在追逐過程中，傳說中的寶可夢「急凍鳥」曾短暫現身，但阿徹為了追趕火箭隊而錯失了拍攝的絕佳機會。
混亂的挖掘與石油意外
火箭隊帶著小山豬強行尋找溫泉，小山豬雖然有所反應並開始挖掘，但沒想到挖出來的不是溫泉，而是黑色的液體。火箭隊一度以為自己成了「石油大王」，但隨即發現他們只是意外挖斷了地下的石油輸送管線。就在他們因闖禍而打算逃跑時，小智利用夜巡靈找到了他們的蹤跡，雙方隨即展開對峙。
小山豬的奮起與奇蹟溫泉
面對火箭隊拒絕歸還寶可夢，小智派出小鋸鱷，小霞則派出蚊香君應戰。美紀夫看著心愛的小山豬被欺負，也指揮隆隆岩加入戰鬥。此時，原本溫馴的小山豬們因為火箭隊的惡行而感到憤怒，主動要求參戰。在美紀夫的指揮下，小山豬展現出強大的戰鬥力，以「細雪」將火箭隊凍結，再配合小智與小霞的「水槍」攻擊，成功將火箭隊擊飛。
大團圓結局
戰鬥結束後，原本因狀態不佳而無法精準感知溫泉的小山豬們，似乎因為剛才的戰鬥暖身而找回了勘測的感覺。牠們在附近重新選定地點，成功幫助美紀夫挖掘到了噴湧而出的真正溫泉。美紀夫與小雪對小智一行人的幫助感激不盡，眾人也享受到了努力後的成果。最後，阿徹與小智等人告別了美紀夫一家，繼續朝著急凍鳥飛去的山脈進發。